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shasha87铁虫 (小有名气)
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高斯优化中怎样固定内坐标
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| 各位大神好，我有一个问题想请教一下。我在高斯03中优化Hg(CH3)Cl分子，想把其内坐标固定，但是Hg-X不固定（英文是：Internal coordinates were held fixed, except Hg-X)。输入文件要怎么写，需要哪些关键字。谢谢。帮帮忙吧大家！ |
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zjx187
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shasha87: 金币+5, ★有帮助 2013-09-10 23:16:06
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shasha87: 金币+5, ★有帮助 2013-09-10 23:16:06
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如果你用内坐标表示来表示原子，是不需要加关键词的，比如说下面的CH4分子的内坐标形式 0 1 C H 1 1.07000000 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 3 A2 2 D1 0 H 1 B4 3 A3 2 D2 0 B2 1.07000000 B3 1.07000000 B4 1.07000000 A1 109.47120255 A2 109.47125080 A3 109.47121829 D1 -119.99998525 D2 120.00000060 你把B1的数值放到上面就是固定了1号碳与2号H院子之间的距离，一次类推，就可以固定原子之间的键角以及二面角，希望对你有帮助。 |
2楼2013-09-09 20:21:43
shasha87
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您好，我这样做过，但是发现固定不了，最后还是变了。我把我的输入文件发给你看一下：谢谢你！ %chk=F:\Calculation\1.chk # RHF/Gen Pseudo=Read Opt rhf/cc-pvdz-pp Opt of Hg(CH3)Cl 0 1 Cl Hg 1 R1 C 2 R2 1 180.00 H 3 1.0899 2 109.5901 1 109.5901 H 3 1.0899 2 109.5901 4 109.3521 H 3 1.0899 2 109.5901 5 109.3521 R1=2.3417 R2=2.1040 C H Cl 0 cc-pvdz **** Hg 0 S 7 1.00 41.4804000 0.0100720 22.5328000 -0.1147810 14.0790000 0.3564080 5.7247400 -0.8484430 1.4794800 0.9405960 0.6882660 0.4353290 0.1641810 0.0131780 S 7 1.00 41.4804000 0.0020320 22.5328000 -0.0323140 14.0790000 0.1153500 5.7247400 -0.3177630 1.4794800 0.5135230 0.6882660 0.2500500 0.1641810 -0.6488410 S 7 1.00 41.4804000 0.0218280 22.5328000 -0.1555640 14.0790000 0.3860250 5.7247400 -0.8961040 1.4794800 2.3321950 0.6882660 -1.5976600 0.1641810 -1.0536460 S 1 1.00 0.0572230 1.0000000 P 6 1.00 10.5805000 0.1286920 6.8053900 -0.3608420 1.7901600 0.5641170 0.8622610 0.5002740 0.3752770 0.1137850 0.1284210 0.0029390 P 6 1.00 10.5805000 -0.0344430 6.8053900 0.1009290 1.7901600 -0.1924390 0.8622610 -0.1960690 0.3752770 0.1042040 0.1284210 0.5873870 P 6 1.00 10.5805000 0.0714680 6.8053900 -0.2108590 1.7901600 0.4452040 0.8622610 0.3916080 0.3752770 -0.6670830 0.1284210 -0.6195740 P 1 1.00 0.0434470 1.0000000 D 5 1.00 11.5841000 0.0167290 7.2487900 -0.0695580 1.9366200 0.3034370 0.8987480 0.4548780 0.3869310 0.3368080 D 5 1.00 11.5841000 -0.0249840 7.2487900 0.1041030 1.9366200 -0.6169860 0.8987480 -0.3538260 0.3869310 0.6872800 D 1 1.00 0.1504660 1.0000000 F 1 1.00 0.9974000 1.0000000 **** Hg 0 HG-ECP 5 60 h-ul potential 1 2 1.0000000 0.0000000 s-ul potential 2 2 12.4130710 275.7747970 2 6.8979130 49.2678980 p-ul potential 4 2 11.3103200 80.5069840 2 10.2107730 161.0348240 2 5.9398040 9.0834160 2 5.0197550 18.3677730 d-ul potential 4 2 8.4078950 51.1372560 2 8.2140860 76.7074590 2 4.0126120 6.5618210 2 3.7953980 9.8180700 f-ul potential 2 2 3.2731060 9.4290010 2 3.2083210 12.4948560 g-ul potential 2 2 4.4852960 -6.3384140 2 4.5132000 -8.0998630 |
3楼2013-09-10 09:17:52
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