| 查看: 1738 | 回复: 7 | ||
yeahhanpei金虫 (正式写手)
|
[求助]
高斯优化分子固定问题 已有1人参与
|
| 一篇文章中提到优化分子without geometry relaxation，那这是怎么操作的，是在各原子后边写上-1代表固定，然后再优化么?如果是这样，一运行就会报错 |
回复此楼» 猜你喜欢
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有2人回复
-
【陕西师范大学】催化化学方向招收2026年博士研究生1名（申请-考核）
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有257人回复
-
中国水产科学研究院黄海水产研究所博士后科研工作站2026年博士后招收公告
已经有0人回复
-
大连海事大学国家级人才团队2026年博士研究生招生启事（氢能）
已经有10人回复
-
国家级人才课题组招收2026年入学博士
已经有6人回复
-
意大利米兰理工大学急聘CSC公派留学博士生（物理或无机材料科学方向）
已经有41人回复
-
求加氢处理工艺与工程（第二版）pdf 李大东 中国石化出版社 9787511436689
已经有0人回复
-
新加坡ASTAR招收CSC或学校资助联培博士生/访问学生
已经有1人回复
-
求助Amsterdam Density Functional
已经有0人回复
-
公派出国有好的选择吗？
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于用高斯进行二面角扭转势能的计算
已经有6人回复
- 高斯view怎么样固定分子的对称性进行优化？
已经有15人回复
- 如何固定某个二面角，优化分子其它部分？
已经有4人回复
- 高斯优化中怎样固定内坐标
已经有2人回复
- Fe(001)表面自组装成膜分子力学计算
已经有14人回复
- 在进行高斯计算时如何消去虚频（转载）
已经有18人回复
- 【求助】能量优化、频率分析中的原子限定问题
已经有3人回复
- 【分享】MS晶体建模基本方法（团簇模型）
已经有36人回复
1234zou
金虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1941.5
- 红花: 5
- 帖子: 92
- 在线: 31.6小时
- 虫号: 2914121
- 注册: 2014-01-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
感谢参与，应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
|
显然只能固定部分原子进行优化，你要是全部加上-1固定，那还优化个啥，全都冻住了，显然会报错。所以你要做的是看清楚文章里作者固定的是哪些原子，你也固定那些原子。 要是还不行的话，上传log文件最后的报错信息。 |
2楼2017-08-02 12:39:38
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
送红花一朵 |
谢谢您的回答，我又看了下文章，里面说，为了保持结构不变，在without geometry relaxtion 时，获得了其分子表面静电势。那有一个问题:不优化可以得到.wfn文件么，因为要画esp图。那route是不是把opt去掉就可以了，各原子还用写-1么？ 谢谢您 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-08-02 14:34:58
小范范1989
木虫 (著名写手)
- 应助: 123 (高中生)
- 金币: 3821.3
- 散金: 968
- 红花: 243
- 帖子: 1979
- 在线: 452.8小时
- 虫号: 2013403
- 注册: 2012-09-19
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
4楼2017-08-02 16:11:52
1234zou
金虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1941.5
- 红花: 5
- 帖子: 92
- 在线: 31.6小时
- 虫号: 2914121
- 注册: 2014-01-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2017-08-02 18:22:27
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
6楼2017-08-03 00:13:59
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
7楼2017-08-03 00:14:22
小范范1989
木虫 (著名写手)
- 应助: 123 (高中生)
- 金币: 3821.3
- 散金: 968
- 红花: 243
- 帖子: 1979
- 在线: 452.8小时
- 虫号: 2013403
- 注册: 2012-09-19
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理
8楼2017-08-03 07:48:07