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朱庆平

铜虫 (小有名气)

[求助] 大片段连接载体的有效方法 已有6人参与

最近在做连接实验:用PCR片段(约2kb)连接T载体和表达载体pET-30b,总是连接不上,操作都还规范,也都确定了DNA片段加了A,有酶切位点,连了3、4次了,都连接不上,不知道是什么原因?T载体和加A试剂盒用的都是宝生的,T4DNA连接酶也是宝生的,内切酶是Thermo的,pET-30b载体是实验室保存的。请教各位大侠,这连接到底要注意些什么呢?我以前连接900多bp的片段,无论是连T载体,还是pET-30b,都是一次性连上,怎么片段大了,就死活连不上呢?那么稍大的片段连接载体,有什么窍门呢?需要注意些什么呢?
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kangaroo0513

新虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

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有时候纯属RP问题。。换个人做就ok了。。。呵呵。。要么丢给我我帮你连?或者推荐你无缝克隆
2楼2016-07-17 09:33:50
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普通回帖

原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

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你是怎么确定片段加上A了,测序么?另外为什么同时连T载和pet呢,如果这样就没必要做T载体了,直接连pet就行,2K片段也不算大片段,对连接不会有太大影响,不清楚你连接不上具体是个什么现象呢?压根就没有菌落生长,还是挑到菌落但都是空载呢?我觉得你可以直接pcr产物酶切和pet连,这里和片段大小关系不大,就看你酶切是否完全,pcr产物酶切,首先可以保证pcr产物浓度高一些,然后酶切时间延长,确保有一部分pcr产物是被酶切的。载体的处理就得严谨一些了,我一直建议不要从pet空载出发,空载酶切是否完全很难直观电泳判断,如果你手里有已经构建好的pet重组质粒,含有你需要的酶切位点,你可以用它来回收你的目的条带,这样可以通过是否有小片段切出来,判断载体是否被切开了,相对会靠谱些。最后就是连接前检测下片段和载体,看看是否真的回收到了,很多时候。前面进行很好,回收完就去连,但实际上回收那一步出问题,压根就没有回收的片段或者浓度很低,都会导致连接失败。如果片段载体都回收到了,连接体系尽可能的减少载体量,比方说10微升体系,载体1到2微升,片段你可以加8微升甚至超过10微升都可以的,目的就是哪怕只有十个菌落,我也要保证这10个里面有几个是正确的,而不是几百个菌落找不到一个正确

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天空才是极限,我有信心飞的更高!
3楼2016-07-17 11:14:34
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eagle_07

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

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用Taq酶做PCR是会在PCR产物两条链的3‘端加上一个A,基于此原理产物能通过T4DNA连接酶连入T载体。连载体时,产物的量要比载体的量大,一般比例要求在3:1及以上。2kb的片段还不算大太,一般还好连。不知你PCR后有没有对回收产物测浓度,如果浓度过低,可以通过多做几管PCR或增加PCR循环数来产物的量,然后再回收。另外,连接转化后,不定一要得到很多细菌克隆,只要所挑的几个菌能找到一个阳性克隆就足够了。
4楼2016-07-19 09:14:52
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yjqhades

禁虫 (初入文坛)

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5楼2016-07-19 14:27:58
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小冀-

版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

片段其实不太大~三四千的连着也没什么问题,你试着把片段多加点,我们那时候直接用1:10体系,而且我感觉有的时候真的很靠运气
···
6楼2016-07-20 18:36:31
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MMCCBB

新虫 (著名写手)

重新做载体,有需要可以私聊

发自小木虫IOS客户端
7楼2016-07-20 19:05:35
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Liumengya

木虫 (正式写手)

2k根本不算大。t载实在不行就直接用试剂盒

发自小木虫Android客户端
8楼2016-07-20 22:22:36
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lvbolantao

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

我觉得4楼和6楼说的对,连接的比例很重要,注意是摩尔比,而不是简单的体积比
活在当下
9楼2016-07-21 11:30:15
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biosci

捐助贵宾 (职业作家)


10楼2016-07-21 16:53:33
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