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prthefu

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[交流] ORF finder 翻译氨基酸，为什么显示的是反向序列翻成的氨基酸呢已有3人参与

我手上有一段蛋白的基因，师兄说给的我是全长。
然后，我在ORF finder上输入后找ORF,出的结果如下图1，首先，找到的ORF有那么多，而且前面frame有什么+1、-1、+2、-2、+3、-3，不懂什么意思，我只是觉得最长的可能是自己需要的。所以，我点开了最长的那个，有了序列后，发现下面的序列编号是倒着呢，而且和我之前输入的序列还是反向互补的。
这是为什么？？？
求解？？？

360截图20160323144023005.jpg

360截图20160323144053343.jpg

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1楼 2016-03-23 14:39:09

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Sunshine092

木虫 (小有名气)

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你最好问问你师兄啊。有可能他给的序列就是这个基因的反向互补序列，将你师兄给你的序列反向互补之后再去ORF finder 网站上去看一下，把那个最长的氨基酸序列去NCBI blast 一下http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 看这个氨基酸序列与别的物种相同基因编码的氨基酸序列的相似度如何。