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最近做一个数据库只有预测序列的新基因,想确定其真实的ORF,请GS指点
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在线: 46.2小时
虫号: 1360422
注册: 2011-08-03
性别: GG
专业: 遗传学与生物信息学
[
求助
]
最近做一个数据库只有预测序列的新基因,想确定其真实的ORF,请GS指点
最近在扩一个新基因,NCBI和ensembl里只有预测序列。我把自己扩出的cDNA用ORF Finder分析了一下,起始密码子的位置还在NCBI和ensemb预测的起始位置5‘端90bp, 不知道实际在细胞内哪个才是真正地翻译起始位点。请高手们给点建议,我怎样来确定真实的起始位点?
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2012-07-27 20:39:15
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虫号: 1207015
注册: 2011-02-20
性别: GG
专业: 发育生物学
【答案】应助回帖
可以在扩cDNA的时候 ,能 扩出 来的 orf就是 能 实际表达的orf,可能 存在多种 orf哟
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going for
2楼
2012-12-30 00:48:26
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