| 查看: 2665 | 回复: 4 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
prthefu木虫 (著名写手)
|
[交流]
ORF finder 翻译氨基酸，为什么显示的是反向序列翻成的氨基酸呢 已有3人参与
|
||
|
我手上有一段蛋白的基因，师兄说给的我是全长。 然后，我在ORF finder上输入后找ORF,出的结果如下图1，首先，找到的ORF有那么多，而且前面frame有什么+1、-1、+2、-2、+3、-3，不懂什么意思，我只是觉得最长的可能是自己需要的。所以，我点开了最长的那个，有了序列后，发现下面的序列编号是倒着呢，而且和我之前输入的序列还是反向互补的。 这是为什么？？？ 求解？？？  360截图20160323144023005.jpg  360截图20160323144053343.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有114人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于mrna的orf阅读框的问题
已经有3人回复
- 求助，请问有预测ORF的软件吗？？谢谢！
已经有9人回复
- RACE获得的cDNA序列没有3‘非翻译区
已经有2人回复
- 关于设计克隆引物时产物片段大小有限制吗，如果我没有全长要怎么做能克隆到它的全长
已经有14人回复
- 诱导不表达
已经有11人回复
- cDNA全长和ORF 的关系？
已经有8人回复
- 在线查找ORF的工具，除了ORF FINDER 和 SOFTBERRY 还有哪个网站可以做？
已经有2人回复
- 载体构建时多了3个碱基问题大不
已经有5人回复
- 不同剪切体的鉴定？
已经有2人回复
- 宏基因组的ORF预测
已经有10人回复
- 一个拼接序列分别在NCBI（限定拟南芥）和TAIR10中Blast时结果为何不一样？
已经有2人回复
- DNA序列分析
已经有1人回复
- orf finder结果分析中没有变颜色的部分是内含子吗
已经有0人回复
- 最近做一个数据库只有预测序列的新基因，想确定其真实的ORF，请GS指点
已经有1人回复
- 找开放阅读框
已经有1人回复
- ORF Finder的使用遇到问题
已经有0人回复
prthefu
木虫 (著名写手)
- 应助: 20 (小学生)
- 金币: 2573.9
- 散金: 81
- 红花: 14
- 沙发: 1
- 帖子: 1551
- 在线: 187小时
- 虫号: 3083070
- 注册: 2014-03-24
- 性别: MM
- 专业: 生物海洋学与海洋生物资源
4楼2016-03-24 17:09:32
Sunshine092
木虫 (小有名气)
- 应助: 12 (小学生)
- 金币: 2882.9
- 红花: 1
- 帖子: 110
- 在线: 187.6小时
- 虫号: 3015492
- 注册: 2014-03-04
- 专业: 细胞信号转导
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
| 你最好问问你师兄啊。有可能他给的序列就是这个基因的反向互补序列，将你师兄给你的序列 反向互补之后 再去ORF finder 网站上去看一下，把那个最长的氨基酸序列去NCBI blast 一下http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Bl ... ;LINK_LOC=blasthome 看这个氨基酸序列与别的物种相同基因编码的氨基酸序列的相似度如何。 |
2楼2016-03-24 10:37:35
534720018
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 16954.6
- 散金: 20
- 红花: 15
- 帖子: 2505
- 在线: 190.4小时
- 虫号: 1394302
- 注册: 2011-09-07
- 性别: GG
- 专业: 环境工程
3楼2016-03-24 10:43:24
5楼2017-10-12 14:22:42
