24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 4011  |  回复: 20

小胖芙芙

新虫 (初入文坛)

[求助] 求助!!短片段(169 bp)PCR扩增,用Takara La Taq酶,不出条带呀。。。。 已有5人参与

小白第一次发帖,各位大神见谅。。。。
以前用普通的2×Taq PCR Mix扩增,它含的酶是Taq DNA Polymerase,扩增条带是169 bp,当时可以出条带,亮度可以。也送测了的,返回结果有的位点是双峰。
因为提的DNA是混合物,现在想做克隆看看混合物的成分,就换成了Takara的La taq,但是不出条带了呀。。。引物没变,PCR条件也没变。。。。
我的条件是这样的:
(1)94℃ 5min
(2)94℃ 30s
(3)51 ℃ 30s
(4)72℃ 45s
(5)(2)-(4)39
(6)72℃ 10min
(7)4℃ forever
求各位大神帮帮忙,看看有没有啥问题啊。。。。
有啥没说到的,各位大神尽管问。。。。。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

dragonhmw

铁杆木虫 (正式写手)

2楼2016-03-06 07:24:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

fudan671

木虫 (著名写手)

重新摸索条件,怀疑da降解

发自小木虫IOS客户端
3楼2016-03-06 07:43:36
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yilberg

新虫 (小有名气)

4楼2016-03-06 08:38:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jackyoung

新虫 (正式写手)

重新摸索条件是正道,这么点儿的片段用LA Taq有点儿浪费了。Anyway,最忌讳这种一个条件P到底的情况。

发自小木虫Android客户端
CestLaVie
5楼2016-03-06 08:45:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
片段那么短,就用那个mix也行,保真性一般也行了,多送一两个测序就好了。La Taq不是用于长片段的吗(我忘了)。还有你的延伸时间可以缩短,有20s足够了,补充延伸也要缩短,40个循环是不是太多了。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

6楼2016-03-06 08:46:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张凡云

至尊木虫 (职业作家)

第一点,双峰的结果是不是你想要的结果?不是的话,麻烦你的引物重新设计,不够特异性,第二点,你可以用高保真酶就可以啊,La酶是长片段扩增用的吧?

发自小木虫IOS客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

7楼2016-03-06 09:07:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

原海亮

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
不到200的片段用普通酶应该可以拿到正确的序列的,突变率还是比较低的,对于你测序是双峰,不知道你送测的样品是什么?测序结果一点正确的都没有?如果是PCR产物,建议将pcr产物进行胶回收或者过柱纯化后测序,另一个办法即将pcr产物连接到T载体测序。另外实验中不同的酶更换后,条件还是要重新摸索的,特别退火温度,因为经常会出现普通酶可以而高保真的酶不行。我不太清楚第二种酶的延伸速度,不到200的片段应该不用那么长延伸时间吧,循环数也适当减少些,祝好!

发自小木虫Android客户端

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

天空才是极限,我有信心飞的更高!
8楼2016-03-06 09:12:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小胖芙芙

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by dragonhmw at 2016-03-06 07:24:03
不应该啊,溶液体系是什么?

溶液体系是:
LA Taq 0.25微升
pcr buffer 2.5微升
dNTP Mix 2微升
primers    1/1微升
ddH2O     17.25微升
DNA  1微升


对了,LA taq是125U的

发自小木虫Android客户端
9楼2016-03-06 10:06:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

小胖芙芙

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2016-03-06 08:46:12
片段那么短,就用那个mix也行,保真性一般也行了,多送一两个测序就好了。La Taq不是用于长片段的吗(我忘了)。还有你的延伸时间可以缩短,有20s足够了,补充延伸也要缩短,40个循环是不是太多了。

开始想的是用LA就可以不用单独加A尾了,它确实是扩长的,以前用它扩过500bp的片段是没有问题的。循环数我也试着降一下吧,谢谢。。

发自小木虫Android客户端
10楼2016-03-06 10:16:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小胖芙芙 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 071010 323 分求调剂 +3 Baekzhy 2026-03-27 3/150 2026-03-30 14:24 by andresqi
[考研] 求调剂,一志愿 南京航空航天大学大学 ,080500材料科学与工程学硕 +6 @taotao 2026-03-26 7/350 2026-03-30 10:43 by 我是小康
[考研] 一志愿中南大学化学0703总分337求调剂 +6 niko- 2026-03-27 6/300 2026-03-30 10:25 by herarysara
[考研] 318一志愿吉林大学生物与医药 求调剂 +5 笃行致远. 2026-03-28 5/250 2026-03-30 06:56 by ilovexiaobin
[考研] 085600,材料与化工321分求调剂 +10 大馋小子 2026-03-28 10/500 2026-03-29 23:35 by 飞行日记西
[考研] 086000生物与医药调剂 +5 Feisty。 2026-03-28 9/450 2026-03-29 12:02 by longlotian
[考研] 305求调剂 +8 RuiFairyrui 2026-03-28 8/400 2026-03-29 08:22 by fmesaito
[考研] 347求调剂 +3 山顶见α 2026-03-25 3/150 2026-03-28 14:13 by 唐沐儿
[考研] 药学105500求调剂 +3 Ssun。。 2026-03-28 3/150 2026-03-28 11:24 by lxf170613
[考研] 086000调剂 +3 7901117076 2026-03-26 3/150 2026-03-27 21:34 by Jianing_Mi
[考研] 化学调剂 +4 爱吃番茄的旭 2026-03-24 5/250 2026-03-27 17:50 by kiokin
[考研] 274求调剂 +17 顾九笙要谦虚 2026-03-24 23/1150 2026-03-27 15:16 by caszguilin
[考研] 286求调剂 +4 lim0922 2026-03-26 4/200 2026-03-27 10:28 by guoweigw
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 351求调剂 +4 麦克阿磊 2026-03-24 4/200 2026-03-27 00:32 by wxiongid
[考研] 336材料求调剂 +7 陈滢莹 2026-03-26 9/450 2026-03-27 00:20 by wxiongid
[考研] 309求调剂 +4 gajsj 2026-03-25 5/250 2026-03-26 00:27 by Dyhoer
[考研] 07化学303求调剂 +5 睿08 2026-03-25 5/250 2026-03-25 22:46 by 418490947
[考研] 材料专硕 335 分求调剂 +4 拒绝冷暴力 2026-03-25 4/200 2026-03-25 18:45 by haxia
[考研] 085404电子信息284分求调剂 +4 13659058978 2026-03-24 4/200 2026-03-24 12:15 by syl20081243
信息提示
请填处理意见