24小时热门版块排行榜    

查看: 2840  |  回复: 20

Ritaaaaaa

新虫 (初入文坛)

[求助] 用挂着酶切位点的引物跑PCR结果跑不出来啊!小白求救啊! 已有4人参与

要做HEK293表达一种GPCR,然后老板让我试试直接用挂着酶切微店的引物跑PCR,已经试了9次了,一直不成功。
引物: F: GCC 酶切位点 序列前端25bp
          R: 序列末端25bp 酶切位点 CCG

片段长是2078bp, ORF 1688bp
用的LA Taq.  PCR 程序试过很多种,推荐的2 step 和正常的3step, 还有各种退火温度都试过了。
也试过用PCR产物为模板再跑一次PCR了,就是看不到条带啊。
其中有一次看到条带了,结果小于1600bp.

已经耽误了好多天了,求救啊师兄师姐们,
研一的小白要疯掉了。
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

leisure797

铁杆木虫 (职业作家)

百里登风

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
友情支持:高保真的酶,takara 的pyrobest,Thermo的Phusion,还有FastPfu
笑一个!
2楼2016-01-25 10:19:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

王世玉

新虫 (初入文坛)

可以换一下酶试试
3楼2016-01-25 10:47:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Ritaaaaaa

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by leisure797 at 2016-01-25 10:19:31
友情支持:高保真的酶,takara 的pyrobest,Thermo的Phusion,还有FastPfu

实验室都不用这些欸。下午换了KOD-plus酶,还是没有条带。TnT
4楼2016-01-25 20:25:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

noblefire

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
gpcr是真核的基因,你用的模板是cDNA么?可能是模板的问题,因为用cDNA一般很容易扩增。你用的酶几乎是最好的了,虽然大材小用了。
实在不行先设计一段500bp的片段(介于你的酶比引物贵多了),扩增一下看看模板有没有问题。

发自小木虫Android客户端
5楼2016-01-25 21:08:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

noblefire

铁虫 (小有名气)

补充:你的R引物反向互补了么?

发自小木虫Android客户端
6楼2016-01-25 21:10:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mlbiosci

新虫 (正式写手)

个人认为上下游引物tm值要保持一样,这是最重要的

发自小木虫Android客户端
7楼2016-01-25 23:46:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhufadi

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你的r引物出问题了,把酶切位点挂r引物的5,端吧,拿着引物问问实验室的师兄师姐们去吧!

发自小木虫IOS客户端
世上无难事,只怕有心人!
8楼2016-01-25 23:51:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

buthey

金虫 (正式写手)

你上下游引物直接用的这段序列的前端和末端,然后加上了酶切位点么?   你的引物符合引物设计的规则不

发自小木虫Android客户端
9楼2016-01-26 00:21:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiangzz555

新虫 (小有名气)

10楼2016-01-26 01:21:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Ritaaaaaa 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +11 医学老男孩 2026-08-13 29/1450 2026-08-14 00:04 by 大快人心啦
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[硕博家园] 一作与独作在应聘高校教师时区别大吗 +3 mbygzh 2026-08-08 4/200 2026-08-13 19:31 by 龙-樱
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 28/1400 2026-08-13 17:51 by 医学老男孩
[基金申请] filecode +14 documentary 2026-08-10 16/800 2026-08-13 16:39 by 润生71
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] 不应该看fileCode +7 且听虎啸 2026-08-12 9/450 2026-08-13 14:27 by flydreamws
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 结合人工智能,周易传统文化,filecode打分制来了,3分以上希望很大。 +3 Tide man 2026-08-12 4/200 2026-08-13 08:35 by ZJTJZ
[基金申请] 2019年青年基金涵评意见,大家看看几个A,几个B? +11 Tide man 2026-08-11 11/550 2026-08-13 07:35 by 撸猫猫
[基金申请] 综述论文作为代表作会不会影响评审专家的印象分? +11 yufeiwaner 2026-08-09 13/650 2026-08-12 08:17 by yufeiwaner
[基金申请] 为什么网上很多人说本周 12号出结果 +6 瞬息宇宙 2026-08-10 7/350 2026-08-11 19:25 by Tide man
[基金申请] 关于代码变化问题,想知道的进来 +17 且听虎啸 2026-08-07 24/1200 2026-08-10 18:35 by zhangduo2008
[基金申请] 这样的filecode谁见过 +11 布布和一二 2026-08-08 22/1100 2026-08-10 11:10 by wmfsnow
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
[基金申请] 关于filecode,很负责任的告诉大家 +6 爱看书的可乐 2026-08-08 7/350 2026-08-08 22:13 by a_niu
[基金申请] 国基金的申报应该改成非等额制,评价高的钱多评价低的钱少,但是增加资助率 +7 a089 2026-08-07 7/350 2026-08-08 18:05 by gltch
[基金申请] 化学口download_prp&fileCode的固定段好像这几天一直没变,有变的大神么? +3 Tide man 2026-08-07 4/200 2026-08-07 22:39 by Tide man
[基金申请] filecode变化情况 +6 布布和一二 2026-08-07 22/1100 2026-08-07 14:45 by 且听虎啸
信息提示
请填处理意见