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易农植保

新虫 (初入文坛)

[求助] 毕赤酵母蛋白表达纯化 已有3人参与

各位大神,如图所示,只看最右边的两个泳道,第一个是marker,倒数四个条带的分子量分别是10,15,25,35kD,第二个泳道是表达的目的条带,过了一个镍柱,1、按说应该就是目的条带了,空载是没有这个条带的,这个胶上没有跑空载,我还做过western,也能杂出目的条带,但是目的蛋白理论分子量本来应该是18kD左右,用原核表达出来的也是18kD左右,但是现在酵母表达出来的都在25kD附近了,好大,载体是ppiczαA,菌株是KM71H;2、过柱子纯化后的蛋白跑出来老是这个样子,显得好宽,我降低浓度后跑胶也是这么个样子,只是颜色浅一点,不知道是咋回事?胶浓度是15%的;3、而且还有一个现象是,有几次染色后脱色,时间脱久了后竟然把条带给脱没了,不知道是不是染色液用的次数太久了。希望有经验的大神帮忙解答一下,多谢啦

毕赤酵母蛋白表达纯化
IMG_0854.jpg
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紫苏薄荷

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
有可能是被糖基化了

发自小木虫Android客户端
2楼2016-01-24 18:04:37
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紫苏薄荷

铜虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
易农植保: 金币+10, ★★★很有帮助, 嗯嗯 2016-01-26 20:33:20
您可以先试试看有没有活性,要是没有的话用去糖基化酶试试

发自小木虫Android客户端
3楼2016-01-24 18:06:47
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易农植保

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 紫苏薄荷 at 2016-01-24 18:04:37
有可能是被糖基化了

这个蛋白最初是直接从真菌的液体培养基中分离纯化出来的  那个时候分子量就只有18kD左右  说明应该是没有糖基化位点的吧

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-01-24 18:08:01
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
易农植保: 金币+10, ★★★很有帮助, 麻烦您再看一下我给您回复的问题 2016-01-26 20:33:04
引用回帖:
4楼: Originally posted by 易农植保 at 2016-01-24 18:08:01
这个蛋白最初是直接从真菌的液体培养基中分离纯化出来的  那个时候分子量就只有18kD左右  说明应该是没有糖基化位点的吧
...

既然已经克隆表达,理论蛋白分子量应该可以计算出来吧,如果理论的小于18kDa,天然提取得到18kDa,就可能糖基化,而酵母的分子量更大可能是糖基化的糖链更长。
为什么
5楼2016-01-24 21:12:38
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yanfang2012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
易农植保: 金币+5, ★★★很有帮助, 好的 谢谢 2016-01-26 20:32:01
楼主你的浓缩胶呢?条带太宽可能是浓缩不好,可以加大浓缩胶的体积,还有电泳的时候注意不要漏液,中间槽的电泳液漏的话也会影响最终的效果,如果已经开始跑胶发现漏液要及时补加
believe yourself!
6楼2016-01-25 10:23:30
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a2703521

金虫 (小有名气)

123

这胶跑的比我技术还差
7楼2016-01-26 16:32:17
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易农植保

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 547star at 2016-01-24 21:12:38
既然已经克隆表达,理论蛋白分子量应该可以计算出来吧,如果理论的小于18kDa,天然提取得到18kDa,就可能糖基化,而酵母的分子量更大可能是糖基化的糖链更长。...

理论分子量就是18kd多一点  所以应该是没有糖基化的  这是不是说明可能被毕赤酵母给糖基化了?
8楼2016-01-26 20:31:02
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547star

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
8楼: Originally posted by 易农植保 at 2016-01-26 20:31:02
理论分子量就是18kd多一点  所以应该是没有糖基化的  这是不是说明可能被毕赤酵母给糖基化了?...

应该说,很可能被糖基化了,毕赤酵母表达发生糖基化很正常吧;还可以考虑进一步分析序列是否有糖基化位点,可以同酶处理蛋白把可能的糖链切割后检测比较,可以换一种蛋白电泳缓冲液制胶电泳,估计MOPS的会分离得好一些,从Marker判断应该从大往小分子量数数,还可以添加原核表达的做对照。
为什么
9楼2016-02-20 11:53:38
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mickey2018

新虫 (初入文坛)

您好,我是清华生命学院的三年级研究生,想向您借点pPICZ载体,不知道方不方便?
10楼2016-03-24 00:03:35
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