应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子晶体结构优化
221/3返回列表123下一页
查看: 3763  |  回复: 21
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小周zj123

新虫 (初入文坛)

[求助] MS分子晶体结构优化 已有1人参与

各位大神，小弟想请教一下如何能够将构建的有机分子直接拉进一个晶格内，请大神们指点。多谢了。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

xuexijisuan

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-11-23 22:40:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hnurenkui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 06:57:51
你好，怎么建一个空盒子呢，我再建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它田间一个盒子？谢谢...

build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。

发自小木虫Android客户端
赞一下(2人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
5楼2015-11-24 15:03:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键移动；按住shift，鼠标右键旋转分子。相互作用的话就几何优化然后计算能量的变化。
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
2楼2015-11-23 23:02:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
14楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 16:02:13
不好意思，还是失败了，一复制完就是这么个情况，而且想删除三个留一个移动到盒子里，结果选中一个删除就都没了，请问是怎么回事啊？非常感谢！

$~YBA_SRLK71S4QDJWB4SN6.png
...

是想要这样的图吗
MS分子晶体结构优化
001.png


MS分子晶体结构优化-1
002.png
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
16楼2015-11-24 20:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
我上面写的很清楚了，只能帮楼主到这了……

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
18楼2015-11-24 21:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
请认真看我的留言，1.取消对称性2.选四个碳环中的一个，复制，粘贴。 严格按我写的做。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
21楼2015-11-24 22:07:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我再建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它田间一个盒子？谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2015-11-24 10:57:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我在建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它添加一个盒子？谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2015-11-24 10:58:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 15:03:44
build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。
...

楼上回复的对
回复此楼
每个人只能陪你走一段路程
6楼2015-11-24 15:20:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 15:03:44
build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。
...

非常感谢，可是我建好了盒子，也建了一个长碳纳米管，将管子复制黏贴过去时出了这个错误是怎么回事啊？
MS分子晶体结构优化-2
EO0]7XL63G3$H5%EXQGJJC0.png


MS分子晶体结构优化-3
J{VU08Z36P1(CM]Q]@9(W90.png
赞一下 回复此楼
7楼2015-11-24 16:28:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-24 15:20:12
楼上回复的对...

谢谢
回复此楼
8楼2015-11-24 16:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 12:28:18
非常感谢，可是我建好了盒子，也建了一个长碳纳米管，将管子复制黏贴过去时出了这个错误是怎么回事啊？

EO0]7XL63G3$H5%EXQGJJC0.png

J{VU08Z36P1(CM]Q]@9(W90.png
...

你的SWNT是周期性结构的，不能直接复制，需要去掉周期性，操作为： 激活SWNT文件，点击build-symmetry-nonperiodic struture. 然后复制，粘贴过去就行了。
赞一下 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
9楼2015-11-24 16:42:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-24 11:20:12
楼上回复的对...

同道中人啊
回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
10楼2015-11-24 16:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小周zj123 的主题更新
221/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 材料与化工085600，总分304，本科有两篇sci参与，求调剂 +4 幸运的酱酱 2026-03-22 5/250 2026-03-22 20:15 by edmund7
[考研] 一志愿中南化学（0703）总分337求调剂 +9 niko- 2026-03-19 10/500 2026-03-22 16:08 by ColorlessPI
[考研] 求调剂院校信息 +6 CX 330 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:25 by 无懈可击111
[考研] 0856材料专硕353求调剂 +4 NIFFFfff 2026-03-20 4/200 2026-03-22 09:49 by 2026paper
[基金申请] 山东省面上项目限额评审 +4 石瑞0426 2026-03-19 4/200 2026-03-22 08:50 by Wei_ren
[考研] 286分人工智能专业请求调剂愿意跨考！ +4 lemonzzn 2026-03-17 8/400 2026-03-21 22:49 by lemonzzn
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 332求调剂 +3 凤凰院丁真 2026-03-20 3/150 2026-03-21 10:27 by luoyongfeng
[考研] 085601调剂 358分 +3 zzzzggh 2026-03-20 4/200 2026-03-21 10:21 by luoyongfeng
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 083200学硕321分一志愿暨南大学求调剂 +3 innocenceF 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:35 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 材料与化工 322求调剂 +4 然11 2026-03-19 4/200 2026-03-20 22:12 by luoyongfeng
[考研] 中南大学化学学硕337求调剂 +3 niko- 2026-03-19 6/300 2026-03-20 21:58 by luoyongfeng
[考研] 工科材料085601 279求调剂 +7 困于星晨 2026-03-17 9/450 2026-03-20 17:38 by 无懈可击111
[考研] 材料考研调剂 +3 xwt。 2026-03-19 3/150 2026-03-19 11:22 by w沐阳w
[考研] 材料，纺织，生物（0856、0710），化学招生啦 +3 Eember. 2026-03-17 9/450 2026-03-18 10:28 by Eember.
[考研] 275求调剂 +4 太阳花天天开心 2026-03-16 4/200 2026-03-17 10:53 by 功夫疯狂
[考研] 333求调剂 +3 文思客 2026-03-16 7/350 2026-03-16 18:21 by 文思客
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭