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fentuo1203新虫 (初入文坛)
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[交流]
关于MS中CASTEP表面优化和MORPOLOGY模块中无限长链的问题 已有1人参与
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各位好,我是MS的初级入门者,在使用过程中,由于知识不够,经验不足,碰到了很多问题,其中比较困扰我,让我无法前进的有两个问题。 第一个是关于CASTEP表面优化的问题。我想用它来做一下晶体表面吸附,晶体是氯化物的离子晶体,是根据FINDIT的晶格参数来构建的。切完面加了真空层之后进行优化,建立了2*2的超胞,如图1所示,根据教程想做避免弛豫,就把下层原子固定了,为红色部分。但是在优化之后却发现原子层相对于真空层的位置发生了变化,如图2所示,这让我比较困惑,按道理靠近真空层的表面是放松的,这样小分子加在真空层中进行吸附,但是这么大的变化,我不知道小分子该加在哪里了。 http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1413955060_823.jpg(图1) http://image.keyan.cc/data/bcs/2 ... _1413955103_805.jpg(图2) 第二个是关于MORPOLOGY模块中无限长链的问题。文献知道用该模块可以模拟晶体的生长形貌。用BFDH方法是不加力场,直接计算就可以了,但是用GROWTH和EQUILIBRIUM方法时,就会提示晶胞中有无限长链结构,无法进行计算。查阅了小木虫上面关于此方面的帖子,有些说建立超晶胞,然后建立更大的盒子把它装起来,不知道是怎么操作。我尝试着用重建晶胞的方法,把abc的值都增加,虽然在计算上没有了无限长链的提醒,但是却没有生长的形貌图。不知是做法错误还是什么情况,请各位大神能够不吝赐教。非常感谢! NiCl2 cell 003).jpg NiCl2 cell 003)2.jpg |
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