应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » MS分子晶体结构优化
221/3返回列表123下一页
查看: 3762  |  回复: 21
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

小周zj123

新虫 (初入文坛)

[求助] MS分子晶体结构优化 已有1人参与

各位大神，小弟想请教一下如何能够将构建的有机分子直接拉进一个晶格内，请大神们指点。多谢了。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

xuexijisuan

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2015-11-23 22:40:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

hnurenkui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 06:57:51
你好，怎么建一个空盒子呢，我再建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它田间一个盒子？谢谢...

build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。

发自小木虫Android客户端
赞一下(2人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
5楼2015-11-24 15:03:44
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键移动；按住shift，鼠标右键旋转分子。相互作用的话就几何优化然后计算能量的变化。
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
2楼2015-11-23 23:02:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
14楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 16:02:13
不好意思，还是失败了，一复制完就是这么个情况，而且想删除三个留一个移动到盒子里，结果选中一个删除就都没了，请问是怎么回事啊？非常感谢！

$~YBA_SRLK71S4QDJWB4SN6.png
...

是想要这样的图吗
MS分子晶体结构优化
001.png


MS分子晶体结构优化-1
002.png
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
16楼2015-11-24 20:56:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
我上面写的很清楚了，只能帮楼主到这了……

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
18楼2015-11-24 21:40:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
请认真看我的留言，1.取消对称性2.选四个碳环中的一个，复制，粘贴。 严格按我写的做。

发自小木虫Android客户端
赞一下(1人) 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
21楼2015-11-24 22:07:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我再建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它田间一个盒子？谢谢
赞一下 回复此楼
3楼2015-11-24 10:57:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-23 23:02:01
没太看懂你的问题，是想计算分子的大小，还是要计算有机分子与金属之间的相互作用。如果是计算分子大小，就先构建一个盒子，然后把有机物分子复制过去。操作上一般是选中有机物分子，然后按住ctrl和shift，鼠标右键 ...

你好，怎么建一个空盒子呢，我在建碳纳米管的时候没有出现盒子，不知道怎么给它添加一个盒子？谢谢
赞一下 回复此楼
4楼2015-11-24 10:58:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiezhou5322

银虫 (正式写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 15:03:44
build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。
...

楼上回复的对
回复此楼
每个人只能陪你走一段路程
6楼2015-11-24 15:20:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by hnurenkui at 2015-11-24 15:03:44
build.......crystals......build crystals......选默认1p1 ...build.....即为一个没有任何对称性的盒子。 然后把你的碳纳米管放进去，调整相对大小和位置。
...

非常感谢，可是我建好了盒子，也建了一个长碳纳米管，将管子复制黏贴过去时出了这个错误是怎么回事啊？
MS分子晶体结构优化-2
EO0]7XL63G3$H5%EXQGJJC0.png


MS分子晶体结构优化-3
J{VU08Z36P1(CM]Q]@9(W90.png
赞一下 回复此楼
7楼2015-11-24 16:28:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

橙子学术

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-24 15:20:12
楼上回复的对...

谢谢
回复此楼
8楼2015-11-24 16:31:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 橙子学术 at 2015-11-24 12:28:18
非常感谢，可是我建好了盒子，也建了一个长碳纳米管，将管子复制黏贴过去时出了这个错误是怎么回事啊？

EO0]7XL63G3$H5%EXQGJJC0.png

J{VU08Z36P1(CM]Q]@9(W90.png
...

你的SWNT是周期性结构的，不能直接复制，需要去掉周期性，操作为： 激活SWNT文件，点击build-symmetry-nonperiodic struture. 然后复制，粘贴过去就行了。
赞一下 回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
9楼2015-11-24 16:42:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hnurenkui

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by jiezhou5322 at 2015-11-24 11:20:12
楼上回复的对...

同道中人啊
回复此楼
难的不是事情本身，而是开始行动的勇气！
10楼2015-11-24 16:43:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 小周zj123 的主题更新
221/3返回列表123下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 293求调剂 +3 涛涛Wjt 2026-03-22 5/250 2026-03-22 22:21 by jiangpengfei
[考研] 280分求调剂 一志愿085802 +4 PUMPT 2026-03-22 7/350 2026-03-22 22:13 by 星空星月
[考研] 石河子大学（211、双一流）硕博研究生长期招生公告 +3 李子目 2026-03-22 3/150 2026-03-22 21:01 by 怎么释怀
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 生物学071000 329分求调剂 +5 我爱生物生物爱� 2026-03-17 5/250 2026-03-22 16:42 by tcx007
[考研] 305分求调剂（食品工程） +4 Sxy112 2026-03-21 6/300 2026-03-22 15:26 by 无懈可击111
[考研] 291 求调剂 +3 化工2026届毕业� 2026-03-21 3/150 2026-03-22 14:26 by ColorlessPI
[考研] 考研调剂 +3 呼呼？~+123456 2026-03-21 3/150 2026-03-21 20:04 by 无际的草原
[考研] 求调剂 +4 要好好无聊 2026-03-21 4/200 2026-03-21 18:57 by 学员8dgXkO
[考研] 材料 271求调剂 +5 展信悦_ 2026-03-21 5/250 2026-03-21 17:29 by 学员8dgXkO
[考研] 求调剂 +6 Mqqqqqq 2026-03-19 6/300 2026-03-21 08:04 by JourneyLucky
[考研] 化学求调剂 +4 临泽境llllll 2026-03-17 5/250 2026-03-21 02:23 by JourneyLucky
[考研] 一志愿中国石油大学（华东） 本科齐鲁工业大学 +3 石能伟 2026-03-17 3/150 2026-03-21 02:22 by JourneyLucky
[考研] 材料专硕英一数二306 +7 z1z2z3879 2026-03-18 7/350 2026-03-20 23:48 by JourneyLucky
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +22 rare12345 2026-03-18 22/1100 2026-03-20 20:39 by zhukairuo
[考研] 求调剂 +3 暗涌afhb 2026-03-16 3/150 2026-03-20 00:28 by 河南大学校友
[考研] 一志愿中国海洋大学，生物学，301分，求调剂 +5 1孙悟空 2026-03-17 6/300 2026-03-19 23:46 by zcl123
[考研] 有没有道铁/土木的想调剂南林，给自己招师弟中～ +3 TqlXswl 2026-03-16 7/350 2026-03-17 15:23 by TqlXswl
[考研] 一志愿南京大学，080500材料科学与工程，调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[论文投稿] 有没有大佬发小论文能带我个二作 +3 增锐漏人 2026-03-17 4/200 2026-03-17 09:26 by xs74101122
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭