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a13515517892

木虫 (小有名气)

[交流] qpcr实验复孔后的问题 已有8人参与

做细胞水平的验证时,发生了很诡异的结果,就是我的目的基因都P出来,并且重现性和复孔之间的差距都很小,但是内参基因GAPDH确很不稳定,复孔之间会差5个以上的Ct值,我做了8次了,每次都不一样,而且差距都很大,复孔之间始终存在很大的差异,以前做组织时都没有这种现象,但是GAPDH的溶解曲线峰值很好,都是83.5,而且没有杂峰。我为了防止可能是自己操作的误差,把所有Mix和模板,引物都加在一个管子里混匀了,在分到不同的PCR管中,可是复孔之间还是差距很大。我做了4个复孔,有3个复孔的Ct12,有1个复孔是4。跑胶的结果是12和4的复孔的亮度没什么区别,你觉得可能是什么原因呢?

组织和细胞水平一起做的时候,组织中的GAPDH都很正常,复孔之间没有什么差距,就是细胞特别不稳定。
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444565008qq

新虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我只想问一下,你的重复直接差异小怎么做到的,我的重复直接有大有小,很不稳定
2楼2015-10-25 19:52:00
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3楼2015-10-25 21:43:25
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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的gapdh ct太低了,稀释一下,让他维持在15-18,浓度太高了ct 会不稳定

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向钱看,向厚赚
4楼2015-10-25 23:51:39
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懒蛋

铁杆木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
其实有三个重复都是12,那4那个重复就可以不算了,要那么多重复你老板不心疼?

发自小木虫IOS客户端
向钱看,向厚赚
5楼2015-10-25 23:53:43
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sankok

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
浓度太高加上仪器感光问题

发自小木虫Android客户端
6楼2015-10-26 00:44:56
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1992wuyan

新虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你的Ct值都太小了,那么小已经不稳定了,12和4应该都是不准确的,需要稀释模板,将Ct值变大再算
7楼2015-10-26 10:43:04
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zhuguiqiu

禁虫 (文坛精英)

本帖内容被屏蔽

8楼2015-10-26 11:28:49
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足下客

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
你这个内参基因的Ct值太靠前了吧,一般内参的Ct值要在20几啊,建议你把内参至少稀释1000倍试一下。估计是在细胞水平中,这个内参基因的浓度太高了,Ct值太小,就是很不稳定。
9楼2015-10-27 16:48:03
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happyboy_34

木虫 (著名写手)

…ing


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
来学习的。
从回复看,再加上以前做qPCR的经验,应该就是内参Ct值太低/浓度太高/表达量太高 的缘故了。
真理无处不在,但却非唾手可得。
10楼2015-10-29 09:36:34
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