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行板如歌

金虫 (小有名气)

[求助] 新手,求助一个问题,如何验证转录因子与目的基因互作?有哪些方法呢? 已有3人参与

RT-qPCR实验筛选出了几个差异表达的基因,对这几个基因启动子区域分析,表明启动子区域含有一个能与ARF转录因子结合的顺式作用元件,但是用什么方法能验证ARF转录因子真的结合在该基因的启动子上呢?先前实验室只做到定量表达分析上,没有做过验证,有什么方法能验证蛋白质与DNA的结合呢?
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Neo2000

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
行板如歌: 金币+5, 有帮助, 实验室没有酵母体系,不知道有公司做这个没有? 2015-09-18 19:15:36
做个酵母单杂就行

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2楼2015-09-18 16:09:05
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wx3280065

银虫 (小有名气)

3楼2015-09-18 16:10:57
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wx3280065

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
行板如歌: 金币+5, 有帮助, 送公司应该选什么技术来测比较准确呢? 2015-09-18 19:16:33
引用回帖:
3楼: Originally posted by wx3280065 at 2015-09-18 16:10:57
酵母单杂交,凝胶迁移

送公司把,估计一两k就出来了,酵母杂交实验要建酵母体系,很麻烦,凝胶阻滞实验要用到放射性同位素。

发自小木虫Android客户端
4楼2015-09-18 16:14:56
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wangtaodluf

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
行板如歌: 金币+5, 有帮助, 谢谢,我研究下chip的操作流程 2015-09-18 19:17:32
chip应该是目前最直接的证明

发自小木虫Android客户端
5楼2015-09-18 16:54:30
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huagnshaowu

禁虫 (正式写手)

本帖内容被屏蔽

6楼2015-09-18 18:24:25
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7楼2015-09-18 18:36:43
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wx3280065

银虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by wx3280065 at 2015-09-18 16:14:56
送公司把,估计一两k就出来了,酵母杂交实验要建酵母体系,很麻烦,凝胶阻滞实验要用到放射性同位素。
...

这个不清楚,我们课题组去年也遇到这问题,最后定的做酵母,因为我们的转录因子还设计到与其他蛋白形成异二聚体的问题,所以单杂双杂一起做了,就没有考虑免疫共沉淀和凝胶阻滞实验。

发自小木虫Android客户端
8楼2015-09-19 06:36:19
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734699268

新虫 (初入文坛)

9楼2015-09-19 11:53:13
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