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hhedu-ny木虫 (著名写手)
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[交流]
关于半定量PCR问题
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| 最近在做半定量PCR，没接触过这方面的，老师突然让做这个，有个疑问，就是想问问各位大神就是跑出来之后Ct的数据该怎么处理啊，我是每个基因四个复孔，我是把目的基因和内参基因的四个值取平均（如果SD大舍去一个）算的，采用2(-ΔΔCt)法，结果就是最后每组浓度对应的各个目的基因就只都有一个值，我想知道最后画图文献里的误差棒是什么SD，是最后算出来的倍数的SD，还是ΔΔCt或ΔCt的SD值呢？希望个人虫友了解的给普及一下，在下感激不尽。。。 |
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hhedu-ny
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8楼2015-08-04 20:54:48
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
hhedu-ny: 金币+4 2015-08-05 09:38:28
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
hhedu-ny: 金币+4 2015-08-05 09:38:28
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你这已经不是半定量了。。。看这算法这已经是相对定量。还有，四个复孔，这个的取舍要看溶解曲线，我虽然没做过几次，但是有个老师做给我看，我还记得，是在溶解曲线界面就把波动太大的舍去，不一定算平均值每个样本的重复都一样。另外，我有个相对定量的Excel表格，天亮去实验室看能不能发给你，以前有师姐给的。把自己的数值粘进入，一拖就出来了。（我本科毕业论文用到这个相对定量pcr，可是学的不太深，现在还没做这方面的也没再仔细学过，只能帮你这么点了） [ 发自小木虫客户端 ] |
11楼2015-08-05 02:45:00
12楼2015-08-05 02:49:52
Crescendo
铁杆木虫 (著名写手)
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13楼2015-08-05 08:13:20
100