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细菌通用引物27F和1492R
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取个什么名啊
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细菌通用引物27F和1492R
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上下游引物之间退火温度相差11度,怎么确定最适退火温度?
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2015-08-03 16:09:14
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haloarchaeon
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1、扩增细菌16SrRNA基因建议用27F和1541R,因为1541R能靶定3‘末端,可以得到比较长的16SrRNA基因,而1492R获得的产物比较短。
2、对于退火温度,我实验室常用55度。
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取个什么名啊
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haloarchaeon
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2015-08-04 14:46:51
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2015-08-04 15:16:11
以Tm值低的那个数减去5度所得的值为初始退火温度,PCR后根据结果调整,多半是提高温度直到结果满意
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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2楼
2015-08-04 10:06:51
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3楼
:
Originally posted by
haloarchaeon
at 2015-08-04 14:46:51
1、扩增细菌16SrRNA基因建议用27F和1541R,因为1541R能靶定3‘末端,可以得到比较长的16SrRNA基因,而1492R获得的产物比较短。
2、对于退火温度,我实验室常用55度。
用你说的引物能得到多大的片段,我看的文献上一般用的都是1492R和27F
[ 发自小木虫客户端 ]
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5楼
2015-08-04 15:18:30
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4楼
:
Originally posted by
haloarchaeon
at 2015-08-04 14:55:06
关于退火温度可以用“PCR引物(寡核苷酸)计算器”计算,以两条引物中低的Tm值为退火温度,如果有smear,可以提高温度。
我算了,两者差的还是很多
[ 发自小木虫客户端 ]
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6楼
2015-08-04 15:18:54
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