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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

[求助] 配合物结构优化 已有2人参与

本人想对一个金属配合物进行一个能量优化,高斯计算前要确保结构正确,现在的问题是,计算过程中总出现断键,有人提示是分子模型构建出了问题,不知哪位能用chemoffice给我优化下所给结构的构型,使得在chem3D里能进行mini energy,不甚感谢。

配合物结构优化
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yaochuang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-11 10:40:44
关于三价铬的三配位络合物,谢谢...

这是Chem3D做初步优化后的结构,你看看能不能用,不过你的是离子可能是不是需要固定电荷什么的~

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  • 2015-07-11 16:48:25, 3.4 K
10楼2015-07-11 16:48:44
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普通回帖

yaochuang

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
你如何确定是断键了呢?

如果使用GaussianView看的话,那就有问题了,因为GaussianView显示的键是不准确的,特别是对配合物。
2楼2015-07-10 10:27:35
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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by yaochuang at 2015-07-10 10:27:35
你如何确定是断键了呢?

如果使用GaussianView看的话,那就有问题了,因为GaussianView显示的键是不准确的,特别是对配合物。

chk文件里也是断的
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3楼2015-07-10 14:41:47
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yaochuang

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-10 14:41:47
chk文件里也是断的...

这是很常见的,因为GaussianView中显示的键其实是没有意义的。具体有没有断键是要根据原子间的距离自己判定的。你查看一下配位键的长度,如果和试验中的键长相差不大,那就没有断键。
4楼2015-07-10 15:57:12
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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by yaochuang at 2015-07-10 15:57:12
这是很常见的,因为GaussianView中显示的键其实是没有意义的。具体有没有断键是要根据原子间的距离自己判定的。你查看一下配位键的长度,如果和试验中的键长相差不大,那就没有断键。...

离得很远,非正常
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5楼2015-07-10 20:49:11
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yaochuang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-10 20:49:11
离得很远,非正常...

还需要在chem3D里能进行mini energy吗? 你可以把分子发给我~
6楼2015-07-11 08:48:43
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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
6楼: Originally posted by yaochuang at 2015-07-11 08:48:43
还需要在chem3D里能进行mini energy吗? 你可以把分子发给我~...

关于三价铬的三配位络合物,谢谢

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  • 2015-07-11 10:40:10, 3.13 K
让天赋自由,以为爱珍惜!
7楼2015-07-11 10:40:44
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forever1706

禁虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
分子结构验证过吗?
8楼2015-07-11 12:46:26
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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
8楼: Originally posted by forever1706 at 2015-07-11 12:46:26
分子结构验证过吗?

基本没错
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9楼2015-07-11 14:17:37
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