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陈攀211

铜虫 (初入文坛)

[求助] 配合物结构优化 已有2人参与

本人想对一个金属配合物进行一个能量优化，高斯计算前要确保结构正确，现在的问题是，计算过程中总出现断键，有人提示是分子模型构建出了问题，不知哪位能用chemoffice给我优化下所给结构的构型，使得在chem3D里能进行mini energy,不甚感谢。

配合物结构优化
Z1TJ$V$TD[VC1TXG`4W50~8.png
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让天赋自由，以为爱珍惜！
1楼 2015-07-10 09:46:09
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yaochuang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-11 10:40:44
关于三价铬的三配位络合物，谢谢...

这是Chem3D做初步优化后的结构，你看看能不能用，不过你的是离子可能是不是需要固定电荷什么的~
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  • 附件 1 : Untitled-1.gjf
    • 2015-07-11 16:48:25, 3.4 K
10楼2015-07-11 16:48:44
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yaochuang

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你如何确定是断键了呢？

如果使用GaussianView看的话，那就有问题了，因为GaussianView显示的键是不准确的，特别是对配合物。
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2楼2015-07-10 10:27:35
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陈攀211

铜虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by yaochuang at 2015-07-10 10:27:35
你如何确定是断键了呢？

如果使用GaussianView看的话，那就有问题了，因为GaussianView显示的键是不准确的，特别是对配合物。

chk文件里也是断的
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让天赋自由，以为爱珍惜！
3楼2015-07-10 14:41:47
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yaochuang

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by 陈攀211 at 2015-07-10 14:41:47
chk文件里也是断的...

这是很常见的，因为GaussianView中显示的键其实是没有意义的。具体有没有断键是要根据原子间的距离自己判定的。你查看一下配位键的长度，如果和试验中的键长相差不大，那就没有断键。
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4楼2015-07-10 15:57:12
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