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xtulidan

新虫 (小有名气)

[求助] 配合物结构优化 已有3人参与

本人想用高斯09 opt-DFT优化一个配合物的结构,使用的是B3LYP以及6-31+基组,过程老断键,不知如何是好,有没有哪位能提供一些建议或则输入文件,感谢!

配合物结构优化
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配合物结构优化-1
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122ybb

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1, 谢谢交流 2015-07-08 15:54:42
你的这个输入文件是个平面分子吗,如果是,你应该先将其稍加修改,使其原子不在同一平面上,然后再优化
明天比今天更好!
2楼2015-07-08 15:39:06
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xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 122ybb at 2015-07-08 15:39:06
你的这个输入文件是个平面分子吗,如果是,你应该先将其稍加修改,使其原子不在同一平面上,然后再优化

不是,chem3D里显示的不是平面分子,MM2进行能量初步优化时,有些原子识别不了,但是可以进行高斯计算,但是,就是会出现断键的情况。
3楼2015-07-08 17:53:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用GV打开你用于计算的输入文件,看看初始结构是否合理。或者你贴出你的输入文件
4楼2015-07-09 08:22:47
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xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 08:22:47
用GV打开你用于计算的输入文件,看看初始结构是否合理。或者你贴出你的输入文件

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  • 附件 1 : UNTITLED-2.LOG
  • 2015-07-09 08:39:20, 4.27 K
5楼2015-07-09 08:39:43
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 08:39:43
...

贴输入文件,不是输出
6楼2015-07-09 08:49:36
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xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 08:49:36
贴输入文件,不是输出

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  • 附件 1 : INPUTE.txt
  • 2015-07-09 10:53:25, 33.32 K
7楼2015-07-09 10:53:32
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 10:53:32

看了一下你的输入,你是想做结构优化,还是路径追踪?
建议你先做结构优化找到并确定了过渡态,再读取过渡态结构和力常数做IRC
8楼2015-07-09 12:50:33
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xtulidan

新虫 (小有名气)

引用回帖:
8楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 12:50:33
看了一下你的输入,你是想做结构优化,还是路径追踪?
建议你先做结构优化找到并确定了过渡态,再读取过渡态结构和力常数做IRC...

结构优化
9楼2015-07-09 14:58:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

引用回帖:
9楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 14:58:27
结构优化...

那你把irc那块去掉了再算算看
10楼2015-07-09 15:08:23
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