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xtulidan

新虫 (小有名气)

[求助] 配合物结构优化已有3人参与

本人想用高斯09 opt-DFT优化一个配合物的结构，使用的是B3LYP以及6-31+基组，过程老断键，不知如何是好，有没有哪位能提供一些建议或则输入文件，感谢！

配合物结构优化
W@)OA$Q[QQ[6]H]IRE6TR7T.png


配合物结构优化-1
Z1TJ$V$TD[VC1TXG`4W50~8.png
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1楼2015-07-08 15:11:30
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122ybb

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
gmy1990: 金币+1, 谢谢交流 2015-07-08 15:54:42
你的这个输入文件是个平面分子吗，如果是，你应该先将其稍加修改，使其原子不在同一平面上，然后再优化
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明天比今天更好！
2楼2015-07-08 15:39:06
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xtulidan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 122ybb at 2015-07-08 15:39:06
你的这个输入文件是个平面分子吗，如果是，你应该先将其稍加修改，使其原子不在同一平面上，然后再优化

不是，chem3D里显示的不是平面分子，MM2进行能量初步优化时，有些原子识别不了，但是可以进行高斯计算，但是，就是会出现断键的情况。
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3楼2015-07-08 17:53:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
用GV打开你用于计算的输入文件，看看初始结构是否合理。或者你贴出你的输入文件
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4楼2015-07-09 08:22:47
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xtulidan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 08:22:47
用GV打开你用于计算的输入文件，看看初始结构是否合理。或者你贴出你的输入文件

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5楼2015-07-09 08:39:43
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 08:39:43
...

贴输入文件，不是输出
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6楼2015-07-09 08:49:36
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xtulidan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 08:49:36
贴输入文件，不是输出

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7楼2015-07-09 10:53:32
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枪下游魂

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 10:53:32

看了一下你的输入，你是想做结构优化，还是路径追踪？
建议你先做结构优化找到并确定了过渡态，再读取过渡态结构和力常数做IRC
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8楼2015-07-09 12:50:33
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xtulidan

新虫 (小有名气)
引用回帖:
8楼: Originally posted by 枪下游魂 at 2015-07-09 12:50:33
看了一下你的输入，你是想做结构优化，还是路径追踪？
建议你先做结构优化找到并确定了过渡态，再读取过渡态结构和力常数做IRC...

结构优化
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9楼2015-07-09 14:58:27
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枪下游魂

木虫 (著名写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by xtulidan at 2015-07-09 14:58:27
结构优化...

那你把irc那块去掉了再算算看
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10楼2015-07-09 15:08:23
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