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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » NCBI保守结构域怎么分析啊？
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混合配搭

新虫 (小有名气)

[求助] NCBI保守结构域怎么分析啊？ 已有2人参与

有一端氨基酸序列BLAST后，出现这个结果，想问问各位前辈，这个图怎么看，能说明什么问题吗。图中能推测出什么信息啊？

NCBI保守结构域怎么分析啊？
1.jpg
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1楼 2015-04-21 22:32:43
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
说明你的序列中有两个结构域，一个抑制剂家族结构域，一个肽酶/蛋白酶K家族结构域。推测你的蛋白功能可能与这两个家族相似。
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3楼2015-04-22 11:50:21
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
混合配搭: 金币+2 2015-04-22 15:55:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 14:32:31
就分析最上面两个就可以是吗？那下面几个不用看吗？打开最上面两个的链接，就可以看一下具体是什么功能是吗？还可以根据这个推测出其它什么吗？
...

上面两个都是完整的保守结构域家族，也有完整的注释，下面那几个都是一部分截断的保守域，参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释，比如说这个家族都有哪类蛋白，可以依据这些注释帮助你进行蛋白功能的验证。
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大家相互帮助哈
5楼2015-04-22 14:46:06
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
11楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 20:21:27
亚家族？你是说第一排的，第二个那个 肽酶/蛋白酶K家族吗？  我是需要根据第一排这两个推断我的序列是哪个家族的吗？ 活性检测是什么啊？能说的具体点吗？...

你有QQ吗，在这里我感觉给你说不清楚了。
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大家相互帮助哈
12楼2015-04-22 20:52:01
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yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人
同问，顶贴！
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特别喜欢家门口开门的瞬间，宝宝那个高兴呀，蹦蹦跳跳，好不热闹！
2楼2015-04-22 11:40:22
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混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-04-22 11:50:21
说明你的序列中有两个结构域，一个抑制剂家族结构域，一个肽酶/蛋白酶K家族结构域。推测你的蛋白功能可能与这两个家族相似。

就分析最上面两个就可以是吗？那下面几个不用看吗？打开最上面两个的链接，就可以看一下具体是什么功能是吗？还可以根据这个推测出其它什么吗？

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4楼2015-04-22 14:32:31
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
楼上说的对，听他的。
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6楼2015-04-22 15:27:03
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混合配搭

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2015-04-22 14:46:06
上面两个都是完整的保守结构域家族，也有完整的注释，下面那几个都是一部分截断的保守域，参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释，比如说这个家族都有哪类蛋白，可以依据这些注 ...

我可以根据这两个链接打开，根据它们的功能预测我这个蛋白的功能是吗？那可以说明我这个蛋白是哪个家族的吗？
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7楼2015-04-22 15:54:26
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-04-22 15:27:03
楼上说的对，听他的。

8楼2015-04-22 18:46:32
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qaz139687

新虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2015-04-22 14:46:06
上面两个都是完整的保守结构域家族，也有完整的注释，下面那几个都是一部分截断的保守域，参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释，比如说这个家族都有哪类蛋白，可以依据这些注 ...

大神请问下动物的polyA加尾信号有哪些，通常的是AATAAA，那么这些AATAA，AATAAA，AATATA ACTAAA  CATAAA  是不是加尾信号呢 跪求指点
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9楼2015-04-22 18:52:58
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luwei13566

木虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 15:54:26
我可以根据这两个链接打开，根据它们的功能预测我这个蛋白的功能是吗？那可以说明我这个蛋白是哪个家族的吗？...

你把链接打开后鼠标放在亚家族那一栏就会自动弹出来一段字，这段字就是介绍这个保守结构域通常都出现哪一个家族的蛋白上，或者这段序列通常与酶的催化相关这一类比较完整的注释，根据这段注释你就可以推断你蛋白可能属于哪个家族，既然有了这些信息做为指导，你就可以假设这个蛋白很可能是个蛋白酶，接着做一个活性检测，如果有相关的活性，那你就可以得出结论了。第一个的inhibitor家族同理~~
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10楼2015-04-22 19:31:17
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