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混合配搭

新虫 (小有名气)

[求助] NCBI保守结构域怎么分析啊? 已有2人参与

有一端氨基酸序列BLAST后,出现这个结果,想问问各位前辈,这个图怎么看,能说明什么问题吗。图中能推测出什么信息啊?

NCBI保守结构域怎么分析啊?
1.jpg
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
说明你的序列中有两个结构域,一个抑制剂家族结构域,一个肽酶/蛋白酶K家族结构域。推测你的蛋白功能可能与这两个家族相似。
3楼2015-04-22 11:50:21
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luwei13566

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
混合配搭: 金币+2 2015-04-22 15:55:25
引用回帖:
4楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 14:32:31
就分析最上面两个就可以是吗?那下面几个不用看吗?打开最上面两个的链接,就可以看一下具体是什么功能是吗?还可以根据这个推测出其它什么吗?
...

上面两个都是完整的保守结构域家族,也有完整的注释,下面那几个都是一部分截断的保守域,参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释,比如说这个家族都有哪类蛋白,可以依据这些注释帮助你进行蛋白功能的验证。
大家相互帮助哈
5楼2015-04-22 14:46:06
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luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
11楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 20:21:27
亚家族?你是说第一排的,第二个那个 肽酶/蛋白酶K家族吗?  我是需要根据第一排这两个推断我的序列是哪个家族的吗? 活性检测是什么啊?能说的具体点吗?...

你有QQ吗,在这里我感觉给你说不清楚了。
大家相互帮助哈
12楼2015-04-22 20:52:01
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普通回帖

yudaoqian88

至尊木虫 (知名作家)

不良人

同问,顶贴!
特别喜欢家门口开门的瞬间,宝宝那个高兴呀,蹦蹦跳跳,好不热闹!
2楼2015-04-22 11:40:22
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混合配搭

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by stone2239 at 2015-04-22 11:50:21
说明你的序列中有两个结构域,一个抑制剂家族结构域,一个肽酶/蛋白酶K家族结构域。推测你的蛋白功能可能与这两个家族相似。

就分析最上面两个就可以是吗?那下面几个不用看吗?打开最上面两个的链接,就可以看一下具体是什么功能是吗?还可以根据这个推测出其它什么吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
4楼2015-04-22 14:32:31
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

楼上说的对,听他的。
6楼2015-04-22 15:27:03
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混合配搭

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2015-04-22 14:46:06
上面两个都是完整的保守结构域家族,也有完整的注释,下面那几个都是一部分截断的保守域,参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释,比如说这个家族都有哪类蛋白,可以依据这些注 ...

我可以根据这两个链接打开,根据它们的功能预测我这个蛋白的功能是吗?那可以说明我这个蛋白是哪个家族的吗?
7楼2015-04-22 15:54:26
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luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by stone2239 at 2015-04-22 15:27:03
楼上说的对,听他的。

8楼2015-04-22 18:46:32
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qaz139687

新虫 (小有名气)

引用回帖:
5楼: Originally posted by luwei13566 at 2015-04-22 14:46:06
上面两个都是完整的保守结构域家族,也有完整的注释,下面那几个都是一部分截断的保守域,参考价值不大~~把最上面那两个联接打开会有这个保守域家族的基本信息和注释,比如说这个家族都有哪类蛋白,可以依据这些注 ...

大神请问下动物的polyA加尾信号有哪些,通常的是AATAAA,那么这些AATAA,AATAAA,AATATA ACTAAA  CATAAA  是不是加尾信号呢 跪求指点
9楼2015-04-22 18:52:58
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luwei13566

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 混合配搭 at 2015-04-22 15:54:26
我可以根据这两个链接打开,根据它们的功能预测我这个蛋白的功能是吗?那可以说明我这个蛋白是哪个家族的吗?...

你把链接打开后鼠标放在亚家族那一栏就会自动弹出来一段字,这段字就是介绍这个保守结构域通常都出现哪一个家族的蛋白上,或者这段序列通常与酶的催化相关这一类比较完整的注释,根据这段注释你就可以推断你蛋白可能属于哪个家族,既然有了这些信息做为指导,你就可以假设这个蛋白很可能是个蛋白酶,接着做一个活性检测,如果有相关的活性,那你就可以得出结论了。第一个的inhibitor家族同理~~
大家相互帮助哈
10楼2015-04-22 19:31:17
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