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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 在设计引物时为什么对3'端要求那么严格，5’端没什么要求？
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Libra-z

银虫 (小有名气)

[求助] 在设计引物时为什么对3'端要求那么严格，5’端没什么要求？ 已有3人参与

在设计引物时为什么对3'端要求那么严格，5’端没什么要求？
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1楼 2015-04-21 20:50:52
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anglett

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
Libra-z: 金币+1, ★有帮助 2015-04-23 15:16:37
好多DNA酶是都是作用于3‘端，而且DNA复制也是从3’端开始的。
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2楼2015-04-21 20:53:22
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nemo88

禁虫 (小有名气)
★
感谢参与，应助指数 +1
Libra-z: 金币+1, ★有帮助 2015-04-23 15:16:45
本帖内容被屏蔽
3楼2015-04-21 21:14:04
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森林独行者

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Libra-z: 金币+3, ★有帮助 2015-04-23 15:16:51
引物3’端的末位碱基对Taq酶的DNA合成效率有较大的影响。不同的末位碱基在错配位置导致不同的扩增效率，末位碱基为A的错配效率明显高于其他3个碱基，因此应当避免在引物的3’端使用碱基A。另外，引物二聚体或发夹结构也可能导致PCR反应失败。5’端序列对PCR影响不太大，因此常用来引进修饰位点或标记物
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4楼2015-04-23 10:41:12
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