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请帮我看看这个蛋白的图是什么意思啊
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饿的神啊
新虫
(著名写手)
应助: 1
(幼儿园)
金币: 5982.7
散金: 122
帖子: 1004
在线: 66.3小时
虫号: 2477988
注册: 2013-05-23
性别:
MM
专业: 植物病理学
[
求助
]
请帮我看看这个蛋白的图是什么意思啊
已有2人参与
看不太懂,求解释!
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1楼
2015-04-21 14:43:12
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luwei13566
木虫
(正式写手)
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(高中生)
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专业: 微生物生理与生物化学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
第一张图是一级序列加二级结构的图,上面是二级结构把a-螺旋,β-折叠片和无规则卷曲和与之对应的AA序列都标出来了
第二张图是分别用了gene3D、HMMPanther、HMMPfam、profilescan和superfamily对你的这个蛋白保守结构域和亚家族的归类与预测。
第一行用gene3D数据库预测你的这个蛋白的基因序列含有属于Nucleotide-binding domain of ferredoxin-NADP reductase (FNR) module家族的序列
第二行用Panther数据库将你的这个蛋白的序列归类为NADPH OXIDASE (PTHR11972)家族的SF3亚家族
第三行用HMMPfam软件预测到你的这个蛋白上存在编号为PF01794、PF08022、PF08030三个保守结构域
第四行用profilescan数据库在你的蛋白上存在一个在这个数据库中编号为PS51384的结构模型
第五行不知道是个啥
第六行就是个supfamily的一个归类,说明你的蛋白有一部分序列属于编号为SFF52343的一个亚家族序列
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3楼
2015-04-21 18:10:10
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lxj341401
至尊木虫
(著名写手)
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(硕士)
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专业: 生物化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
饿的神啊: 金币+10,
★
有帮助, 谢谢战友的快速回复!
2015-04-23 09:27:42
第一张图是蛋白的二级结构分析,H代表ahpha-螺旋,E代表bata-折叠,C来代表卷曲。
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2楼
2015-04-21 16:36:58
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