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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 微生物基因组打成片段，用什么方法好？
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zenghy

新虫 (小有名气)

[求助] 微生物基因组打成片段，用什么方法好？

准备进行微生物基因组二代测序，需要自己建立文库，已经提取基因组DNA，需要将基因组打成片段，是用超声波还是酶切的方法好？倾向于后者，后者的话用什么酶比较好？
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1楼 2015-04-15 11:01:30
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大孙20111987

新虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by zenghy at 2015-04-16 08:34:11
求超声时间，超几秒，停几秒，多少次好啊？...

15秒一次，中间停5秒。超几次就看你的基因组大小了。
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做好自己，坚持到底
8楼2015-04-16 10:17:06
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假丝酵母

铁虫 (初入文坛)
我们组都是用的超声波，效果还可以
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2楼2015-04-15 11:59:19
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大孙20111987

新虫 (小有名气)
超声好一些吧
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做好自己，坚持到底
3楼2015-04-15 13:03:16
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zenghy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波，效果还可以

超声多长时间啊？
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4楼2015-04-15 15:04:10
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zenghy

新虫 (小有名气)
我在网上查有用Sau3AI酶切，结果订购要三周才能到货，我的天哦。第一次做，没经验啊
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5楼2015-04-15 15:06:40
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zenghy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波，效果还可以

回复详细超声操作方法，送红花啊
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6楼2015-04-15 15:08:25
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zenghy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-15 13:03:16
超声好一些吧

求超声时间，超几秒，停几秒，多少次好啊？
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7楼2015-04-16 08:34:11
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大孙20111987

新虫 (小有名气)
还要看你需要打成多大的片段，这些都很重要。你可以好好查一下文献
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做好自己，坚持到底
9楼2015-04-16 10:21:50
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zenghy

新虫 (小有名气)
引用回帖:
9楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-16 10:21:50
还要看你需要打成多大的片段，这些都很重要。你可以好好查一下文献

都没查到有用的文献，都是用Covaris® instrument打成需要的片段，这些家伙真有钱
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10楼2015-04-16 17:13:43
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