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zenghy

新虫 (小有名气)

[求助] 微生物基因组打成片段,用什么方法好?

准备进行微生物基因组二代测序,需要自己建立文库,已经提取基因组DNA,需要将基因组打成片段,是用超声波还是酶切的方法好?倾向于后者,后者的话用什么酶比较好?
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大孙20111987

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by zenghy at 2015-04-16 08:34:11
求超声时间,超几秒,停几秒,多少次好啊?...

15秒一次,中间停5秒。超几次就看你的基因组大小了。
做好自己,坚持到底
8楼2015-04-16 10:17:06
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假丝酵母

铁虫 (初入文坛)

我们组都是用的超声波,效果还可以
2楼2015-04-15 11:59:19
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大孙20111987

新虫 (小有名气)

超声好一些吧
做好自己,坚持到底
3楼2015-04-15 13:03:16
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zenghy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波,效果还可以

超声多长时间啊?
4楼2015-04-15 15:04:10
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zenghy

新虫 (小有名气)

我在网上查有用Sau3AI酶切,结果订购要三周才能到货,我的天哦。第一次做,没经验啊
5楼2015-04-15 15:06:40
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zenghy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波,效果还可以

回复详细超声操作方法,送红花啊
6楼2015-04-15 15:08:25
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zenghy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-15 13:03:16
超声好一些吧

求超声时间,超几秒,停几秒,多少次好啊?
7楼2015-04-16 08:34:11
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大孙20111987

新虫 (小有名气)

还要看你需要打成多大的片段,这些都很重要。你可以好好查一下文献
做好自己,坚持到底
9楼2015-04-16 10:21:50
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zenghy

新虫 (小有名气)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-16 10:21:50
还要看你需要打成多大的片段,这些都很重要。你可以好好查一下文献

都没查到有用的文献,都是用Covaris® instrument打成需要的片段,这些家伙真有钱
10楼2015-04-16 17:13:43
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