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zenghy

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[求助] 微生物基因组打成片段，用什么方法好？

准备进行微生物基因组二代测序，需要自己建立文库，已经提取基因组DNA，需要将基因组打成片段，是用超声波还是酶切的方法好？倾向于后者，后者的话用什么酶比较好？

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1楼 2015-04-15 11:01:30

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大孙20111987

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7楼: Originally posted by zenghy at 2015-04-16 08:34:11
求超声时间，超几秒，停几秒，多少次好啊？...

15秒一次，中间停5秒。超几次就看你的基因组大小了。

赞一下(1人)

做好自己，坚持到底

8楼2015-04-16 10:17:06

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假丝酵母

铁虫 (初入文坛)

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我们组都是用的超声波，效果还可以

2楼2015-04-15 11:59:19

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大孙20111987

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超声好一些吧

做好自己，坚持到底

3楼2015-04-15 13:03:16

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zenghy

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2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波，效果还可以

超声多长时间啊？

4楼2015-04-15 15:04:10

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zenghy

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我在网上查有用Sau3AI酶切，结果订购要三周才能到货，我的天哦。第一次做，没经验啊

5楼2015-04-15 15:06:40

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2楼: Originally posted by 假丝酵母 at 2015-04-15 11:59:19
我们组都是用的超声波，效果还可以

回复详细超声操作方法，送红花啊

6楼2015-04-15 15:08:25

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3楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-15 13:03:16
超声好一些吧

求超声时间，超几秒，停几秒，多少次好啊？

7楼2015-04-16 08:34:11

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大孙20111987

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还要看你需要打成多大的片段，这些都很重要。你可以好好查一下文献

做好自己，坚持到底

9楼2015-04-16 10:21:50

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9楼: Originally posted by 大孙20111987 at 2015-04-16 10:21:50
还要看你需要打成多大的片段，这些都很重要。你可以好好查一下文献

都没查到有用的文献，都是用Covaris® instrument打成需要的片段，这些家伙真有钱

10楼2015-04-16 17:13:43

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