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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 请问：有谁在美吉生物公司进行全基因组测序
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紫煜紫煜紫煜

新虫 (初入文坛)

[交流] 请问：有谁在美吉生物公司进行全基因组测序 已有5人参与

我们实验室之前在美吉生物公司进行细菌全基因组测序，我对生物信息学的东西都不懂，不是很明白那个公司给的项目结题书的内容，就想问问大家有没有也在那家公司测过的，交流一下！！！
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1楼 2015-03-31 20:06:03
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JNVBNC

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
测过转录组 没测基因组 不明白的可以给他们技术打电话 他们还是蛮耐心的
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2楼2015-04-01 04:33:46
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xingzhou823

木虫 (正式写手)

五道杠
★ ★
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西门吹雪170: 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-04-01 22:42:12
很多时候，测序公司给的只是结果。
至于什么结果好，什么结果坏，结果怎么讨论。这种结论性的结果是不负责的。
推荐一个分析工具，如果自己想学的话。 云生信，http://www.biocloudservice.com ， 目前暂时免费。
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你，长大了吗？~有目的的希望小木虫不要倒闭
3楼2015-04-01 13:25:44
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紫煜紫煜紫煜

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-04-01 13:25:44
很多时候，测序公司给的只是结果。
至于什么结果好，什么结果坏，结果怎么讨论。这种结论性的结果是不负责的。
推荐一个分析工具，如果自己想学的话。 云生信，http://www.biocloudservice.com ， 目前暂时免费。...

谢谢！各位的回复，我现在是要提交全序列，但是我只有组装好的完整序列，用sequin提交到NCBI上，人家回了，要一些组装的内容，但是美吉生物公司也没有给我啊，而且我们测的时间有些久了，公司说信息都没有了，我现在也不知怎么办了，自己也不懂测序的东西，好无助啊！！！从网上提问关于提交全基因组序列的问题，都没有什么人回我！！！
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4楼2015-04-01 15:52:20
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ruociwang

铁虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 紫煜紫煜紫煜 at 2015-04-01 15:52:20
谢谢！各位的回复，我现在是要提交全序列，但是我只有组装好的完整序列，用sequin提交到NCBI上，人家回了，要一些组装的内容，但是美吉生物公司也没有给我啊，而且我们测的时间有些久了，公司说信息都没有了，我现 ...

有原始文件吗？再分析一下不就行了？
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不论付出多少努力，一定要把上海生命科学院的大门给撞开了！
5楼2015-04-01 21:06:41
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紫煜紫煜紫煜

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by ruociwang at 2015-04-01 21:06:41
有原始文件吗？再分析一下不就行了？...

没有吧！！如果图片算的话！公司给的内容，只包括组装好的序列（完成图），还有一个数据文件夹里面都是照片，原始数据质控图，没有文件，照片可以看出来吗？不懂！！
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6楼2015-04-02 15:01:27
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 紫煜紫煜紫煜 at 2015-04-01 15:52:20
谢谢！各位的回复，我现在是要提交全序列，但是我只有组装好的完整序列，用sequin提交到NCBI上，人家回了，要一些组装的内容，但是美吉生物公司也没有给我啊，而且我们测的时间有些久了，公司说信息都没有了，我现 ...

楼主，可以参考我们提交的草图基因组流程：http://www.microbialgenomic.com/细菌基因组分析知识普及.html
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https://www.microbialgenomic.cn/
7楼2015-04-04 20:29:10
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
4楼: Originally posted by 紫煜紫煜紫煜 at 2015-04-01 15:52:20
谢谢！各位的回复，我现在是要提交全序列，但是我只有组装好的完整序列，用sequin提交到NCBI上，人家回了，要一些组装的内容，但是美吉生物公司也没有给我啊，而且我们测的时间有些久了，公司说信息都没有了，我现 ...

楼主，我要批评你，你这本来是个很简单的问题，我发现我都回过你了。还说“从网上提问关于提交全基因组序列的问题，都没有什么人回我！！！”，注意此贴并非广告
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https://www.microbialgenomic.cn/
8楼2015-04-04 20:33:21
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二十一业

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by xingzhou823 at 2015-04-01 13:25:44
很多时候，测序公司给的只是结果。
至于什么结果好，什么结果坏，结果怎么讨论。这种结论性的结果是不负责的。
推荐一个分析工具，如果自己想学的话。 云生信，http://www.biocloudservice.com ， 目前暂时免费。...

云生信没有微生物基因组数据分析工具呀
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9楼2015-04-26 18:24:08
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二十一业

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
将美吉给你的测序拼装好的数据文件用    www.microbetrakr.com   分析一下，得到的结果里面有一项基因组 Genome & Accessory Genome  可以下载基因组文件，这个文件就能直接上传ncbi了。
P.S  其它的是你这个数据的一些分析结果，可以看看美吉分析水平如何。
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10楼2015-04-26 18:28:52
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