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无所谓109

银虫 (正式写手)

[求助] vasp计算带电粒子吸附计算的问题已有3人参与

最近想计算带电粒子在催化剂表面的吸附性质,但是看了手册,和坛子里的介绍,发现对于slab模型,对整个体系加入电荷(NELECT控制),好像计算是有问题的....
这个帖子有过说明http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8266545&fpage=1&target=blank
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/FAQ.html最后五段
vasp官方FAQ中也有过解答。

问题:
1、针对slab模型,调节NELECT去结构优化,是不是完全没有意义
      对一个电中性条件下已优化好的结构(CONTCAR_1),其能量为E1,然后对CONTCAR_1加一个电子并结构优化得到带电下的稳定结构(CONTCAR_2),计算CONTCAR_2在电中性下的能量E2,比较E1和E2来说明材料带电对其结构的影响。这样做有没有意义。对于官方教程,我的理解是带电后,会产生一个静电场,使得能量不准。如果我不横向比较能量(比较带电前后),有没有意义  

2、如果给体系(slab)带上一个电子,然后去吸附电中性的小分子,在这种条件下,所有的能量全是建立在带一个电子的基础上,这样比较吸附的过程能量变化有没有意义。

3、最近也看到过 对体系(slab)加电子模拟,在催化剂表面上超氧负离子O2-还原过程,这么做有没有意义

4、仔细分析了一下啊,产生这些问题的原因都是调控NELECT不能精准地把电子加到某个原子上,有没有其他的软件固定原子的所带的电荷?如果有请告知一下。
      PS:曾经在坛子里看到有说改POTCAR中电子的数目,来调控带电,仔细分析,这样做确实可以调节外来带电粒子A-(slab结构总不含A元素)的电荷,并且把电荷局域到A上,但是POTCAR太深奥,不敢改,也就没有试过...有没有哪位试过,或者看到过类似的做法,希望告知。

非计算出身,自学的vasp,对于理论基础把握不到位,请大家指导。

vasp计算带电粒子吸附计算的问题
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kjsun

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
liliangfang: 金币+2, 辛苦 2015-04-03 07:47:59
无所谓109: 金币+10 2015-07-25 20:55:30
我最近也在研究带电粒子的计算问题。
我发现VASP加电荷不是在体系的最低空轨道加入一个电子,而是在整个空间加入一个背景电荷。(说明书上有相信加入公式)
VASP这么干目的肯定是为了解决一些问题,但是具体什么,我完全不清楚。
但是我测试的结果表明要想用VASP计算带电系统,必须非常非常慎重。
我测试了很多结构,最简单的如  CO2- (就是CO2+1额外电子)
CO2-的结构是非直线型结构,但是VASP优化的结果是直线型。这说明VASP对带电体系的结构优化是不对的。
另外,我的测试结果表明:VASP对带电体系的能量的计算结果也是不对的,至少我测试的那些体系,偏差都极大,完全超出了我的理解范畴。

相应的Gaussian的测试结果则是相对可靠。
6楼2015-04-01 13:50:45
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kjsun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xyzzz986 at 2015-04-01 14:55:28
如果我没猜错的话,你优化CO2-的时候没有调整结构,自然那个电子不容易被CO2捕获。

这个计算量超级小,即使在PC机上也就几分钟的计算量。
你按照你说的正确的方法算一下,然后在把你认为正确的结果发出来,让我们学习一下,如何?
11楼2015-04-01 20:55:53
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