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[交流]
讨论一下带电粒子的吸附和dipole修正问题
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最近看了一篇文章想拿出来和大家讨论一下。我的疑惑是关于带电粒子吸附的问题。 先上这篇文章，见附件，First principles study of the permeability of graphene to hydrogen atoms。 文章讲的故事主要是质子和氢原子穿过石墨烯的问题，作者用了CI-NEB方法分别计算了氢原子和质子透过石墨烯的pathway，和相应的能垒。最终的结果是如果石墨烯没有缺陷不太好穿过去。   乍看之下没觉得有什么问题，动手开始重复的时候问题出现了。作者用的是quantum espresso，虽然没有用过，但是看文章里写的是周期性体系，那么用的应该算是slab模型。 看了VASP手册，发现似乎slab是不能手动设置电荷的。准确说不是不能，而是计算会出问题。见http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/FAQ.html 最后五小结 问题来了: 1. 正是上面提到的，hydrogen atom和proton怎么区分的？ 2. 如果这里不考虑带电问题，就只算hydrogen atom，那么吸附上去以后电荷估计会有转移，那么就有个偶极，按道理讲应该做偶极修正或者用一个对称的adsorbate。但是这里要做permation，所以第二种情况不考虑，所以是不是应该做偶极修正？ 这里有个疑问我一直没仔细去查，不怕笑话提出来吧：计算slab模型的时候需要做个对称结构，那么这个对称是指slab对称还是adsorbates也要对称到另一面去？（直觉上是都要的，电荷转移产生偶极，周期性会对这个有加强） 如果有理解错误恳请指出，欢迎讨论和批评！ |
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2014-12-08 18:50:58, 2.05 M
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