24小时热门版块排行榜    

查看: 5881  |  回复: 15
本帖产生 1 个 1ST强帖 ,点击这里进行查看
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

无所谓109

银虫 (正式写手)

[求助] vasp计算带电粒子吸附计算的问题 已有3人参与

最近想计算带电粒子在催化剂表面的吸附性质,但是看了手册,和坛子里的介绍,发现对于slab模型,对整个体系加入电荷(NELECT控制),好像计算是有问题的....
这个帖子有过说明http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=8266545&fpage=1&target=blank
http://cms.mpi.univie.ac.at/vasp/vasp/FAQ.html最后五段
vasp官方FAQ中也有过解答。

问题:
1、针对slab模型,调节NELECT去结构优化,是不是完全没有意义
      对一个电中性条件下已优化好的结构(CONTCAR_1),其能量为E1,然后对CONTCAR_1加一个电子并结构优化得到带电下的稳定结构(CONTCAR_2),计算CONTCAR_2在电中性下的能量E2,比较E1和E2来说明材料带电对其结构的影响。这样做有没有意义。对于官方教程,我的理解是带电后,会产生一个静电场,使得能量不准。如果我不横向比较能量(比较带电前后),有没有意义  

2、如果给体系(slab)带上一个电子,然后去吸附电中性的小分子,在这种条件下,所有的能量全是建立在带一个电子的基础上,这样比较吸附的过程能量变化有没有意义。

3、最近也看到过 对体系(slab)加电子模拟,在催化剂表面上超氧负离子O2-还原过程,这么做有没有意义

4、仔细分析了一下啊,产生这些问题的原因都是调控NELECT不能精准地把电子加到某个原子上,有没有其他的软件固定原子的所带的电荷?如果有请告知一下。
      PS:曾经在坛子里看到有说改POTCAR中电子的数目,来调控带电,仔细分析,这样做确实可以调节外来带电粒子A-(slab结构总不含A元素)的电荷,并且把电荷局域到A上,但是POTCAR太深奥,不敢改,也就没有试过...有没有哪位试过,或者看到过类似的做法,希望告知。

非计算出身,自学的vasp,对于理论基础把握不到位,请大家指导。

vasp计算带电粒子吸附计算的问题
1.jpg
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

向金字塔顶攀登
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kjsun

木虫 (正式写手)

引用回帖:
8楼: Originally posted by xyzzz986 at 2015-04-01 14:55:28
如果我没猜错的话,你优化CO2-的时候没有调整结构,自然那个电子不容易被CO2捕获。

这个计算量超级小,即使在PC机上也就几分钟的计算量。
你按照你说的正确的方法算一下,然后在把你认为正确的结果发出来,让我们学习一下,如何?
11楼2015-04-01 20:55:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 16 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流。。。。 2015-03-31 10:18:55
franch: 1ST强帖+1, 应助指数+1, 鼓励交流。。。。 2015-03-31 10:22:58
无所谓109: 金币+20 2015-07-25 20:55:15
VASP那个FAQ第五段似乎给出了方案。
1、不见得没意义,以往无法处理过剩电荷原因是因为单胞内带有电荷会导致库伦发散。现在不少程序允许使用凝胶模型,引入背景电荷与过剩电荷相互作用来克服发散的问题。如果不能够使用凝胶模型,那应该是无法进行计算的。但即便如此,过剩电荷可能会引起体系的两个slab之间出现静电作用,比较合适的做法是足够的真空层(最好也考虑work function的校正)。当然,这样的做法可能多少还是存在一些争议。

2、你指的是Mol(-)+Slab=Mol-Slab(-)?这样应该还是可行的吧。3也类似,前提是都是要符合1中提到的条件。

4、这个问题必须搞清楚原理,化合价只是个经典形式电荷的问题,在量子物理中,电子是离域的,强行使之局域在某个原子根本无意义(由于方法缺陷导致的该局域而不局域又是另外一码事)。

不必调整POTCAR,直接指定NELECT结果原则上应该没什么不同吧。还望进一步讨论。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2015-03-29 23:45:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

无所谓109

银虫 (正式写手)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2015-03-29 23:45:56
VASP那个FAQ第五段似乎给出了方案。
1、不见得没意义,以往无法处理过剩电荷原因是因为单胞内带有电荷会导致库伦发散。现在不少程序允许使用凝胶模型,引入背景电荷与过剩电荷相互作用来克服发散的问题。如果不能够 ...

谢谢您的解答,现在对这个问题弄明白了些。早上就分析了一下我的结果,把表面静电势导出来看了看。发现加了电子后,我体系两个slab之间确实存在比较明显的静电场的影响。

您提到的work function校正,能不能简要说说校正方法,之前没处理过work function校正,在坛子里也没有找到相关的计算方法。
vasp计算带电粒子吸附计算的问题-1
1.jpg


vasp计算带电粒子吸附计算的问题-2
12.jpg

向金字塔顶攀登
3楼2015-03-30 16:06:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
3楼: Originally posted by 无所谓109 at 2015-03-30 16:06:34
谢谢您的解答,现在对这个问题弄明白了些。早上就分析了一下我的结果,把表面静电势导出来看了看。发现加了电子后,我体系两个slab之间确实存在比较明显的静电场的影响。

您提到的work function校正,能不能简要 ...

研究一下IDIPOL相关的关键字,偶极校正的信息论坛能找出来不少。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2015-03-30 18:29:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 出来了 +9 trojank 2026-08-26 9/450 2026-08-26 14:25 by 宝贝虫子
[基金申请] 哪位高人中了,把查询到的截图贴出来让我看看,让我长长见识 +4 yuleib84 2026-08-26 5/250 2026-08-26 13:40 by yuleib84
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +4 bjdxyxy 2026-08-26 4/200 2026-08-26 13:12 by qingmu1201
[基金申请] 怎么查啊 +4 huang1991js 2026-08-26 4/200 2026-08-26 11:26 by panjy.cn
[基金申请] 国合里面能看到了 +7 一怀馨秋 2026-08-26 7/350 2026-08-26 11:23 by zhaosm1982
[基金申请] 国际合作可查了,中了面上 +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +6 process2012 2026-08-23 8/400 2026-08-26 11:03 by zjlp
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件,有关系吗? +24 木水思豆 2026-08-25 27/1350 2026-08-26 08:26 by yanchen918
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +8 炎黄贵胄 2026-08-22 9/450 2026-08-26 07:47 by WASM
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候,我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[基金申请] 明天应该可查了!? +6 chengyan1220 2026-08-23 6/300 2026-08-25 19:45 by zfd97
[基金申请] 有没有大神帮我看看基金代码 28+4 1234567wang 2026-08-24 10/500 2026-08-25 19:15 by lfy8008
[基金申请] 今日不放榜?网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[教师之家] 导师吐槽:我怎么摊上了这么个极品研究生! +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 我面上完蛋了 +13 且听虎啸 2026-08-20 14/700 2026-08-25 09:10 by mrkang
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办? +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
请填处理意见