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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 【求助完毕】集群上用vasp计算ELF有ELFCAR而没有DOSCAR是啥问题？
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)

[交流] 【求助完毕】集群上用vasp计算ELF有ELFCAR而没有DOSCAR是啥问题？

计算结束后输出文件列表：


屏幕输出信息：

为什么计算完（电子步收敛，给出能量结果）后Exit code?为什么输出文件列表中有core文件？

INCAR文件：


k-mesh 3*3*1 M-P Auto


这个是啥问题呢？体系模型有问题？

问题已经解决


出问题的计算是用vasp5.2计算的。分别用3个原子，40个原子和80个原子的体系多次测试都是在计算玩总能后卡住，然后非正常结束，  ELFCAR和DOSCAR输出不正常。出现不少core.×文件。

后来改到vasp.4.6.31上运行就没有问题了。修改方法：
为了提高计算速度，需要用到vasp5.2下计算得到的scf结果（ CHGCAR和WAVECAR）。cp scf/* elf/.后需要对一些文件做如下处理：
POSCAR中删掉元素符号一行；
CHGCAR中删掉元素符号一行；
INCAR中按照scl/OUTCAR中的数值补上NGX,NGY,NGZ;NGXF,NGYF,NGZF。
因为vasp4.6与5.2中的默认是不一样的。文件格式不兼容会导致CHGCAR读入出错或者出现其它计算错误。


[ Last edited by cenwanglai on 2010-12-16 at 16:05 ]
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1楼 2010-12-13 15:00:55
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gfei2008

木虫 (小有名气)
★
cenwanglai(金币+2):谢谢回复 2010-12-13 15:50:39
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-13 20:20:54
运算出错了，可能是计算机的节点掉了
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2楼2010-12-13 15:37:05
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by gfei2008 at 2010-12-13 15:37:05:
运算出错了，可能是计算机的节点掉了

运行了两次呢。以第一次以为是集群节点出错。第二次再提交结果还是这样。

很郁闷呢。呵呵。
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3楼2010-12-13 16:06:42
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sars518

木虫 (著名写手)
★
zhang668(金币+1):多谢交流 2010-12-13 19:38:48
cenwanglai(金币+1):谢谢参与 2010-12-16 16:06:08
你换台计算机器算算，比如 编译环境不同的
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4楼2010-12-13 19:36:19
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明月李

铜虫 (小有名气)
问下版主，算出的ELFCAR除了作图，还可以分析什么数据吗？
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5楼2010-12-14 09:56:30
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by 明月李 at 2010-12-14 09:56:30:
问下版主，算出的ELFCAR除了作图，还可以分析什么数据吗？

还是做图。分析成键情况。我也开始学，经验积累中。搜索一下，论坛里有这样的帖子。
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6楼2010-12-14 13:51:57
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
ym23(金币+1):谢谢提示 2010-12-14 21:01:22
cenwanglai(金币+1):谢谢回复！ 2010-12-16 16:06:31
你把LORBIT=11前面的注释去掉看看
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8楼2010-12-14 14:14:39
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2010-12-14 14:14:39:
你把LORBIT=11前面的注释去掉看看

这个有什么关系？我做了一个简单的，单个分子的ELF，和LAECHG=T一起算的。没有设置LORBIT.没有问题的。
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9楼2010-12-14 14:37:39
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
cenwanglai(金币+2):是静态计算。而且是ICHARG=1的静态计算。 2010-12-14 16:45:11
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-12-15 08:08:07
那你做的是不是静态计算呢，一般的计算是没有DOSCAR的。我算DOSCAR都是静态计算时，加上LORBIT，NEDOS，EMAX，EMIN四个参数，一般的弛豫结果DOSCAR都没有
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10楼2010-12-14 15:41:31
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sunyang1988

至尊木虫 (著名写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-12-15 08:08:22
如果不求ELF有没有DOSCAR，试一试吧
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11楼2010-12-14 21:54:52
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kmw.8668

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-12-14 13:51:57:

还是做图。分析成键情况。我也开始学，经验积累中。搜索一下，论坛里有这样的帖子。

请问楼主画ELF用什麽软件啊，我正要学习，但还不知道从那下手？楼主可否指点一下？谢谢啦
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12楼2010-12-15 14:05:11
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢解答 2010-12-15 14:43:19
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2010-12-15 14:05:11:


请问楼主画ELF用什麽软件啊，我正要学习，但还不知道从那下手？楼主可否指点一下？谢谢啦

VASP软件的INCAR中设置
LELF= T就可以算了。跟其它性质计算一样的。

可以参考vasp手册和官方网站。
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13楼2010-12-15 14:07:04
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first_yg

银虫 (小有名气)
★
zzy870720z(金币+1):鼓励交流 2010-12-16 13:31:18
LORBIT=11
是必须的吧？
你可以试试
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14楼2010-12-16 12:08:54
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cenwanglai

荣誉版主 (知名作家)
今天换了vasp.4.6.31来算，可以了。
ELF和LORBIT有什么关系？两个都是处理电荷密度的，相互之间应该没有影响吧？
我试试看结构有什么不同。
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15楼2010-12-16 13:31:35
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future_wl

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
13楼: Originally posted by cenwanglai at 2010-12-15 14:07:04
VASP软件的INCAR中设置
LELF= T就可以算了。跟其它性质计算一样的。

可以参考vasp手册和官方网站。...

在编译VASP 的时候做什么设置才能有计算ELF的功能呢，我现在安装完的VASP不能计算ELF，多谢！
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16楼2014-07-02 15:26:17
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jianglingzh7楼
2010-12-14 14:06   回复  
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