24小时热门版块排行榜    

查看: 4616  |  回复: 15

[交流] 【求助完毕】集群上用vasp计算ELF有ELFCAR而没有DOSCAR是啥问题?

计算结束后输出文件列表:


屏幕输出信息:

为什么计算完(电子步收敛,给出能量结果)后Exit code?为什么输出文件列表中有core文件?

INCAR文件:


k-mesh 3*3*1 M-P Auto


这个是啥问题呢?体系模型有问题?

问题已经解决


出问题的计算是用vasp5.2计算的。分别用3个原子,40个原子和80个原子的体系多次测试都是在计算玩总能后卡住,然后非正常结束,  ELFCAR和DOSCAR输出不正常。出现不少core.×文件。

后来改到vasp.4.6.31上运行就没有问题了。修改方法:
为了提高计算速度,需要用到vasp5.2下计算得到的scf结果( CHGCAR和WAVECAR)。cp scf/* elf/.后需要对一些文件做如下处理:
POSCAR中删掉元素符号一行;
CHGCAR中删掉元素符号一行;
INCAR中按照scl/OUTCAR中的数值补上NGX,NGY,NGZ;NGXF,NGYF,NGZF。
因为vasp4.6与5.2中的默认是不一样的。文件格式不兼容会导致CHGCAR读入出错或者出现其它计算错误。


[ Last edited by cenwanglai on 2010-12-16 at 16:05 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

VASP

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gfei2008

木虫 (小有名气)



cenwanglai(金币+2):谢谢回复 2010-12-13 15:50:39
zzy870720z(金币+1):谢谢提示 2010-12-13 20:20:54
运算出错了,可能是计算机的节点掉了
2楼2010-12-13 15:37:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by gfei2008 at 2010-12-13 15:37:05:
运算出错了,可能是计算机的节点掉了

运行了两次呢。以第一次以为是集群节点出错。第二次再提交结果还是这样。

很郁闷呢。呵呵。
3楼2010-12-13 16:06:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhang668(金币+1):多谢交流 2010-12-13 19:38:48
cenwanglai(金币+1):谢谢参与 2010-12-16 16:06:08
你换台计算机器算算,比如 编译环境不同的
4楼2010-12-13 19:36:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

明月李

铜虫 (小有名气)


问下版主,算出的ELFCAR除了作图,还可以分析什么数据吗?
5楼2010-12-14 09:56:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by 明月李 at 2010-12-14 09:56:30:
问下版主,算出的ELFCAR除了作图,还可以分析什么数据吗?

还是做图。分析成键情况。我也开始学,经验积累中。搜索一下,论坛里有这样的帖子。
6楼2010-12-14 13:51:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ym23(金币+1):谢谢提示 2010-12-14 21:01:22
cenwanglai(金币+1):谢谢回复! 2010-12-16 16:06:31
你把LORBIT=11前面的注释去掉看看
8楼2010-12-14 14:14:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
引用回帖:
Originally posted by sunyang1988 at 2010-12-14 14:14:39:
你把LORBIT=11前面的注释去掉看看

这个有什么关系?我做了一个简单的,单个分子的ELF,和LAECHG=T一起算的。没有设置LORBIT.没有问题的。
9楼2010-12-14 14:37:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cenwanglai(金币+2):是静态计算。而且是ICHARG=1的静态计算。 2010-12-14 16:45:11
zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-12-15 08:08:07
那你做的是不是静态计算呢,一般的计算是没有DOSCAR的。我算DOSCAR都是静态计算时,加上LORBIT,NEDOS,EMAX,EMIN四个参数,一般的弛豫结果DOSCAR都没有
10楼2010-12-14 15:41:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z(金币+1):谢谢讨论 2010-12-15 08:08:22
如果不求ELF有没有DOSCAR,试一试吧
11楼2010-12-14 21:54:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kmw.8668

金虫 (正式写手)


引用回帖:
Originally posted by cenwanglai at 2010-12-14 13:51:57:

还是做图。分析成键情况。我也开始学,经验积累中。搜索一下,论坛里有这样的帖子。

请问楼主画ELF用什麽软件啊,我正要学习,但还不知道从那下手?楼主可否指点一下?谢谢啦
12楼2010-12-15 14:05:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zzy870720z(金币+1):谢谢解答 2010-12-15 14:43:19
引用回帖:
Originally posted by kmw.8668 at 2010-12-15 14:05:11:


请问楼主画ELF用什麽软件啊,我正要学习,但还不知道从那下手?楼主可否指点一下?谢谢啦

VASP软件的INCAR中设置
LELF= T就可以算了。跟其它性质计算一样的。

可以参考vasp手册和官方网站。
13楼2010-12-15 14:07:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

first_yg

银虫 (小有名气)



zzy870720z(金币+1):鼓励交流 2010-12-16 13:31:18
LORBIT=11
是必须的吧?
你可以试试
14楼2010-12-16 12:08:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
今天换了vasp.4.6.31来算,可以了。
ELF和LORBIT有什么关系?两个都是处理电荷密度的,相互之间应该没有影响吧?
我试试看结构有什么不同。
15楼2010-12-16 13:31:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

future_wl

木虫 (著名写手)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
13楼: Originally posted by cenwanglai at 2010-12-15 14:07:04
VASP软件的INCAR中设置
LELF= T就可以算了。跟其它性质计算一样的。

可以参考vasp手册和官方网站。...

在编译VASP 的时候做什么设置才能有计算ELF的功能呢,我现在安装完的VASP不能计算ELF,多谢!
16楼2014-07-02 15:26:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
2010-12-14 14:06   回复  
祝福祝福
相关版块跳转 我要订阅楼主 cenwanglai 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 0XLacIJUOj8D 2026-08-24 6/300 2026-08-25 00:11 by BZKMTicpDhFj
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑,不妨来听听这首《基金之外》 +7 scalable 2026-08-24 7/350 2026-08-24 23:01 by anata1209
[基金申请] 人气不行了 +10 fansofjerry 2026-08-21 10/500 2026-08-24 21:03 by zhanghaozhu
[基金申请] 我面上完蛋了 +9 且听虎啸 2026-08-20 10/500 2026-08-24 20:08 by 苦寒来香
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +21 koalala 2026-08-24 24/1200 2026-08-24 19:25 by 家与远方
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤?
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +17 羊腰板 2026-08-21 19/950 2026-08-24 16:52 by iaeyuan
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +6 炎黄贵胄 2026-08-22 7/350 2026-08-24 11:58 by 6543yes
[基金申请] 让我中一个面上吧! +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 17/850 2026-08-24 10:20 by echo8914667
[基金申请] 什么时候开奖? +10 CrisMessi 2026-08-18 11/550 2026-08-24 06:50 by 开心的小狮子
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +4 process2012 2026-08-23 5/250 2026-08-23 19:58 by jurkat.1640
[基金申请] 今天放榜吗? +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天,20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧? +4 哈哈蛤? 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +9 yuleib84 2026-08-19 11/550 2026-08-21 10:06 by gltch
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +11 yuleib84 2026-08-18 12/600 2026-08-20 11:09 by xskun
信息提示
请填处理意见