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Cute_Dolphin

新虫 (初入文坛)

[求助] 细菌全基因组序列上传到NCBI 已有1人参与

本人用第二代测序(Illumina)获得一株细菌的全基因组序列,现想将序列上传到NCBI,由于刚接触生物信息这块,不太了解,想知道把数据上传到NCBI需要一些什么信息,除了基因序列外,是不是需要每个基因的详细功能注释?注释又有哪些要求呢?求大神指点,最好给出具体的步骤,也希望能推荐一些好用的软件,谢谢。
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


Cute_Dolphin: 金币+1, 有帮助, 没有很好地解答我的问题 2015-04-17 17:42:00
仔细看NCBI的Submission Portal提交网页,基因组提交,可以直接提交裸序列,也可以提交基因注册信息,或者你可以直接用NCBI的自动注释系统进行基因注释,再提交也可以。你可以参考我们提交草图基因组的流程:http://www.microbialgenomic.com/微生物基因组分析中心_培训讲义.html
https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2015-03-28 16:36:57
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charles08

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-28 16:36:57
仔细看NCBI的Submission Portal提交网页,基因组提交,可以直接提交裸序列,也可以提交基因注册信息,或者你可以直接用NCBI的自动注释系统进行基因注释,再提交也可以。你可以参考我们提交草图基因组的流程:http:/ ...

请问一下,序列提交之后是否还可以更改注释信息的,比如我觉得名称分类地位不太相符合的,
3楼2017-12-29 08:12:17
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by charles08 at 2017-12-29 08:12:17
请问一下,序列提交之后是否还可以更改注释信息的,比如我觉得名称分类地位不太相符合的,...

应该是可以修改的,可以给NCBI写邮件(邮箱从基因组提交页面找),说明要更改相关信息,对方会给出相应答复
https://www.microbialgenomic.cn/
4楼2017-12-29 14:21:46
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