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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 细菌全基因组序列上传到NCBI
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Cute_Dolphin

新虫 (初入文坛)

[求助] 细菌全基因组序列上传到NCBI 已有1人参与

本人用第二代测序（Illumina）获得一株细菌的全基因组序列，现想将序列上传到NCBI，由于刚接触生物信息这块，不太了解，想知道把数据上传到NCBI需要一些什么信息，除了基因序列外，是不是需要每个基因的详细功能注释？注释又有哪些要求呢？求大神指点，最好给出具体的步骤，也希望能推荐一些好用的软件，谢谢。
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1楼 2015-03-24 11:31:52
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nanhu1984

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
Cute_Dolphin: 金币+1, ★有帮助, 没有很好地解答我的问题 2015-04-17 17:42:00
仔细看NCBI的Submission Portal提交网页，基因组提交，可以直接提交裸序列，也可以提交基因注册信息，或者你可以直接用NCBI的自动注释系统进行基因注释，再提交也可以。你可以参考我们提交草图基因组的流程：http://www.microbialgenomic.com/微生物基因组分析中心_培训讲义.html
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https://www.microbialgenomic.cn/
2楼2015-03-28 16:36:57
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charles08

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by nanhu1984 at 2015-03-28 16:36:57
仔细看NCBI的Submission Portal提交网页，基因组提交，可以直接提交裸序列，也可以提交基因注册信息，或者你可以直接用NCBI的自动注释系统进行基因注释，再提交也可以。你可以参考我们提交草图基因组的流程：http:/ ...

请问一下，序列提交之后是否还可以更改注释信息的，比如我觉得名称分类地位不太相符合的，
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3楼2017-12-29 08:12:17
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nanhu1984

银虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by charles08 at 2017-12-29 08:12:17
请问一下，序列提交之后是否还可以更改注释信息的，比如我觉得名称分类地位不太相符合的，...

应该是可以修改的，可以给NCBI写邮件（邮箱从基因组提交页面找），说明要更改相关信息，对方会给出相应答复
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https://www.microbialgenomic.cn/
4楼2017-12-29 14:21:46
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