应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » PCR相关 » 菜鸟求助：请问如何查找菌的质粒序列？
61/1返回列表
查看: 1264  |  回复: 5
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

打败番茄炒蛋

新虫 (小有名气)

[交流] 菜鸟求助：请问如何查找菌的质粒序列？

我想查找Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555 （嗜吡啶红球菌）的质粒序列
1：这个菌是模式菌，是不是模式菌的基因组序列都应该能查到？
2：为什么我在NCBI上查不到，只能查到其它嗜吡啶菌的质粒序列。那么请问都是Rhodococcus pyridinivorans（嗜吡啶红球菌）是不是质粒大小数量应该是相同的？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
天生自弃难丽质
1楼 2015-02-05 10:42:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

781055707

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
打败番茄炒蛋(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-05 22:13:17
菌是菌，质粒是质粒呀，质粒主要看图谱。菌也可以是空载的。你要先知道质粒的图谱，然后再NCBI找质粒的DNA序列。一个类型的质粒的BP长度是肯定一样的。你百度就能查到质粒的图谱了。
赞一下 回复此楼
采菊东篱下，悠然见南山。
2楼2015-02-05 10:50:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

打败番茄炒蛋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 781055707 at 2015-02-05 10:50:09
菌是菌，质粒是质粒呀，质粒主要看图谱。菌也可以是空载的。你要先知道质粒的图谱，然后再NCBI找质粒的DNA序列。一个类型的质粒的BP长度是肯定一样的。你百度就能查到质粒的图谱了。

谢谢！ 我本专业是环境的，刚接触分子生物，对这些还不是特别明白。导师让我做一个转基因降解菌，就是把我们现有的菌里的降解质粒通过细菌接合方式导入受体菌中，所以想搞明白受体菌中质粒的大小和结构，但查这株菌的文献查不到具体的质粒名称和序列。
请问这个应该怎么解决呢？
赞一下 回复此楼
天生自弃难丽质
3楼2015-02-05 10:57:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

781055707

木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
打败番茄炒蛋(西门吹雪170代发): 金币+1, 鼓励回帖交流 2015-02-05 22:13:30
Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555 这个是菌名，不是它的质粒，你在NCBI上找到的是它的基因序列。就好比Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555 是个水果篮，你在NCBI上找到的是果篮的编发。的往里面放苹果，梨。苹果，梨就是二种不同的质粒。
赞一下 回复此楼
采菊东篱下，悠然见南山。
4楼2015-02-05 10:59:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

781055707

木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://www.doc88.com/p-2176748202851.html，给你个链接。
赞一下(1人) 回复此楼
采菊东篱下，悠然见南山。
5楼2015-02-05 11:02:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

打败番茄炒蛋

新虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 781055707 at 2015-02-05 10:59:05
Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555 这个是菌名，不是它的质粒，你在NCBI上找到的是它的基因序列。就好比Rhodococcus pyridinivorans DSM 44555 是个水果篮，你在NCBI上找到的是果篮的编发。的往里面放苹果，梨。 ...

这个是我查找到的质粒名称和序列，但是是SB 3940的质粒
是不是和DSM 44555不通用呢？？
菜鸟求助：请问如何查找菌的质粒序列？
无标题.png
赞一下 回复此楼
天生自弃难丽质
6楼2015-02-05 14:55:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 打败番茄炒蛋 的主题更新
61/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上合作单位盖章 +6 ssyjh 2026-08-27 9/450 2026-09-01 20:01 by huagongfeihu
[基金申请] 为什么国自然不能直接公布 +5 bjdxyxy 2026-08-26 5/250 2026-09-01 17:54 by 小伟大博士
[基金申请] 为什么资助数各大高校都创新高，自己申请怎么就这么难 +13 Kittylucky 2026-08-27 14/700 2026-09-01 11:06 by feng6531
[论文投稿] 小白求助 投论文要求的highlights应该如何写 5+3 l1963982152 2026-08-29 4/200 2026-09-01 09:04 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +7 gdd2018 2026-08-28 12/600 2026-09-01 08:32 by 尼古拉斯小虫
[基金申请] 基金未中，这种答复是模板吗？ +6 zhaosm1982 2026-08-27 7/350 2026-08-31 21:18 by qdxxmc
[基金申请] 能否申诉？ +7 echo8914667 2026-08-30 8/400 2026-08-31 17:00 by yihongxu
[基金申请] 29号明天会评吗 +4 笨笨唐 2026-08-28 4/200 2026-08-31 09:30 by huixian257
[基金申请] 基金不中，共勉 +12 eulota 2026-08-26 12/600 2026-08-31 08:42 by ZJTJZ
[基金申请] 有没有仍没收到信息的 +7 德尚中行 2026-08-27 8/400 2026-08-30 20:52 by purplejack
[考博] 找导师 +6 yuanjiabao 2026-08-29 7/350 2026-08-30 14:40 by 生科新手
[基金申请] 国自然面上复盘~欢迎讨论 (金币+15) +15 晴天加油 2026-08-26 16/800 2026-08-29 18:28 by symmetry
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[基金申请] 国合可查了 +3 paperzjh 2026-08-26 3/150 2026-08-26 10:41 by LemmonTr
[基金申请] 牛来！米来！面来！ +8 beefly 2026-08-26 8/400 2026-08-26 08:37 by xuzhipiao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭