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后觉

金虫 (小有名气)

应助: 14 (小学生)
金币: 488.3
红花: 1
帖子: 91
在线: 71小时
虫号: 2091894
注册: 2012-10-28
专业: 药物设计与药物信息

[求助] Glide处理蛋白已有2人参与

小弟菜鸟一只，刚刚尝试使用glide对接，第一步加氢之后
删除了水分子，删除两个钙原子，最后在Het里面发现这是配体要不要删掉啊
Glide要不要删去原来里面的配体分子额。。。多谢大神相助，不知道该怎么弄了。。。

麻烦大家看一下了

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1楼 2015-01-27 20:38:38

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水犹寒ing

铁虫 (初入文坛)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 2.8
帖子: 24
在线: 64.5小时
虫号: 1490072
注册: 2011-11-13
性别: MM
专业: 药物设计与药物信息

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
后觉: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-29 23:37:04

不用吧，可以define ligand的

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寻找心灵的宁静

3楼2015-01-29 21:46:36

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wbf3ng

金虫 (小有名气)

应助: 116 (高中生)
金币: 2086.3
红花: 8
帖子: 255
在线: 171.4小时
虫号: 3202097
注册: 2014-05-13
性别: GG
专业: 理论和计算化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
后觉: 金币+5, ★★★很有帮助, 还是很谢谢你我再看看吧貌似不需要删除确定格点的时候需要 2015-01-28 15:15:23

去水去配体，加极性氢，glid没用过，autodock,sybyl,ledock,gold用过，原理一样，操作应该是差不多

[ 发自小木虫客户端 ]

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2楼2015-01-27 22:32:01

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后觉

[求助] Glide处理蛋白 已有2人参与

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水犹寒ing

【答案】应助回帖

wbf3ng

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