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后觉

金虫 (小有名气)

[求助] Glide处理蛋白 已有2人参与

小弟菜鸟一只,刚刚尝试使用glide对接,第一步加氢之后
删除了水分子,删除两个钙原子,最后在Het里面 发现这是配体 要不要删掉啊
Glide要不要删去原来里面的配体分子额。。。多谢大神相助,不知道该怎么弄了。。。
Glide处理蛋白
Glide处理蛋白-1
麻烦大家看一下了
Glide处理蛋白-2
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
后觉: 金币+5, ★★★很有帮助, 还是很谢谢你 我再看看吧 貌似不需要删除 确定格点的时候需要 2015-01-28 15:15:23
去水去配体,加极性氢,glid没用过,autodock,sybyl,ledock,gold用过,原理一样,操作应该是差不多

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2015-01-27 22:32:01
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水犹寒ing

铁虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
后觉: 金币+5, ★★★★★最佳答案 2015-01-29 23:37:04
不用吧,可以define ligand的
寻找心灵的宁静
3楼2015-01-29 21:46:36
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