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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 启动子分析、预测
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

[交流] 启动子分析、预测 已有2人参与

已知某物种已有全基因组测序，序列ncbi可查。已知A基因CDS，从CDS的ATG上游寻找3000bp序列进行启动子分子，这中选择启动子区域的方法是否正确？另外，接下来应该如何进行具体分析呢？主要是各主要顺式作用元件，包括核心启动子区域，某些转录调控因子的标注等。谢谢各位大神！
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1楼 2015-01-23 14:07:15
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
好急的呀
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2楼2015-01-23 14:08:31
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
plantcare就可以分析，但是不要太迷信这种分析结果。
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3楼2015-01-23 18:40:46
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还重名啊

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
可以问下 你是怎么在全基因组里找的你的基因的启动子的啊
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4楼2015-01-24 00:48:40
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2015-01-23 18:40:46
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
plantcare就可以分析，但是不要太迷信这种分析结果。

我这个是动物的基因序列，用这个软件可行吗？有可能要放到文章里面。对于正负链怎么处理呢。我刚接触这方面内容，希望能帮助下，谢谢
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5楼2015-01-24 12:39:23
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mlbiosci

新虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 还重名啊 at 2015-01-24 00:48:40
可以问下 你是怎么在全基因组里找的你的基因的启动子的啊

只是个大概区域，比较精确的区域我也不会找的，我刚刚接触这方方面内容
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6楼2015-01-24 12:40:41
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