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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

[交流] 启动子分析、预测 已有2人参与

已知某物种已有全基因组测序,序列ncbi可查。已知A基因CDS,从CDS的ATG上游寻找3000bp序列进行启动子分子,这中选择启动子区域的方法是否正确?另外,接下来应该如何进行具体分析呢?主要是各主要顺式作用元件,包括核心启动子区域,某些转录调控因子的标注等。谢谢各位大神!
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

好急的呀
2楼2015-01-23 14:08:31
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hanxiaominhu

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
plantcare就可以分析,但是不要太迷信这种分析结果。
3楼2015-01-23 18:40:46
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还重名啊

铜虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
可以问下 你是怎么在全基因组里找的你的基因的启动子的啊
4楼2015-01-24 00:48:40
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hanxiaominhu at 2015-01-23 18:40:46
http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/
plantcare就可以分析,但是不要太迷信这种分析结果。

我这个是动物的基因序列,用这个软件可行吗?有可能要放到文章里面。对于正负链怎么处理呢。我刚接触这方面内容,希望能帮助下,谢谢
5楼2015-01-24 12:39:23
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mlbiosci

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 还重名啊 at 2015-01-24 00:48:40
可以问下 你是怎么在全基因组里找的你的基因的启动子的啊

只是个大概区域,比较精确的区域我也不会找的,我刚刚接触这方方面内容
6楼2015-01-24 12:40:41
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