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95846713

新虫 (初入文坛)

[求助] pet28a 和pet32a 连接701bp的目的片段后跑电泳图有杂带 ,求分析 已有1人参与

将pet28a和pet32a空质粒与目的条带用相同的酶双酶切后连接,转化至DH5α中,菌液PCR有条带,提质粒后已送测序,等待结果中,将质粒又转化至BL21(DE3)中,挑8个单克隆做菌液PCR有条带,很亮,再从BL21中提质粒pet28a-701, pet32a-701  跑电泳发现有杂带,而之前从DH5α中提质粒未见杂带,在BL21中提质粒跑电泳却又杂带,
pet28a 空质粒5369bp,pet32a空质粒5900bp      目的条带701bp  ,第一个图如图 lane1:15000marker 从上至下为15000,10000,7500,5000,2500,1000,250 bp;
Lane2 :pet28a 空质粒;Lane3:pet28a-701;Lane4:pet32a-701;Lane5:pet28a-701;Lane:pet32a-701;Lane:pet28a-701;Lane8: pet32a-701      
Lane 3-8为挑的不同的单菌落,
我问了一个博士,他说连接过程中可以是多种的构象,有杂带是正常的,Lane 3-8 每个Lane有三个条带,最小的条带是最符合的,但其他两条条带是排列构象不同而已,可以认为都连接上了,我要做做双酶切的图,把701bp目的片段切下来,他说双酶切后条带就都一样了,这种说法合理吗?我就纳闷为什么在DH5α中提出来的重组质粒却没有杂带呢?难道是污染了?

pet28a 和pet32a 连接701bp的目的片段后跑电泳图有杂带 ,求分析
C7G1TCW[SF58G(2C}J`[8EV.png


第二个图 Lane1 15000marker;Lane2:从DH5α中提质粒Pet28a-701;
Lane3 :pet28a 空质粒;Lane4:从DH5α中提质粒Pet32a-701;Lane5:pet32a空质粒;Lane6:1Kb Ladder marker
pet28a 和pet32a 连接701bp的目的片段后跑电泳图有杂带 ,求分析-1
UWXKV~715_{QEY(]MYZ(5FV.jpg

第三个图将pet28a-701和pet32a-701重组质粒转化至BL21后做的菌液PCR
Lane1:2000marker;Lane2-5菌液PCR正确701bp(含有pet28a-701菌液中),Lane6:没加样;Lane:7-10 均为菌液PCR正确701bp(含有pet32a-701菌液中)
pet28a 和pet32a 连接701bp的目的片段后跑电泳图有杂带 ,求分析-2
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781055707

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
95846713: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2015-01-09 12:33:19
BL21(DE3)是蛋白表达型菌株,和DH5A不能比的,BL21(DE3)在用碱提法时我就常是两条带。楼主有三条带,最下面的是质粒双链断裂,线性化的质粒才和你的空载差不多,第二条是质粒单链断裂,第三条是环状质粒。你的博士朋友说的很对,它们都是一个质粒,被酶切以后,就线性化了,条带当然就一样了。楼主有PET28A,32A的空载的话,我们以后可以交换这些实验试剂呀不过楼主的空载跑到了4500,换个marker 试试吧。
采菊东篱下,悠然见南山。
2楼2015-01-06 11:39:23
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95846713

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 781055707 at 2015-01-06 11:39:23
BL21(DE3)是蛋白表达型菌株,和DH5A不能比的,BL21(DE3)在用碱提法时我就常是两条带。楼主有三条带,最下面的是质粒双链断裂,线性化的质粒才和你的空载差不多,第二条是质粒单链断裂,第三条是环状质粒。你的博 ...

刚刚做了酶切  有三条带的质粒 双酶切确实都切开了 谢谢
3楼2015-01-06 20:32:50
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S艾S

新虫 (初入文坛)

你好  我想问一下  我的是pet21载体连接的目的片段  都用然后用的DH5a感受态细胞 然后提出来的质粒  然后用双酶切鉴定  后发现
两条带一条5000一条3000bp  但是我的目的条带应该是600  但是没有带  是不是不对呀

发自小木虫IOS客户端
4楼2016-01-04 16:12:49
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