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山河大川木虫 (著名写手)
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晶体结构中Z值和分子式的确定（期待这次真正弄懂） 已有2人参与
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在晶体解析过程中，Z值和分子式的确定，我一直很糊涂。具体应该如何确定呢？ Z值是晶胞中不对称单元的个数。比如在一个P-1空间群里，一个分子本身存在中心对称，中心原子M处于特殊位置，占有率为0.5，在lst文件 Unit-cell contents from UNIT instruction and atom list resp下面的列表里，显示中心原子M的个数是1。在mercury里看res文件，分子自动就对称过去，长全了。那么分子式里中心原子M就应该按1个来计算对吧，这样在ins文件里SFAC UNIT对应的个数应该是1，是吧，这里也是指晶胞里的个数，对吧。 那这个Z值是多少呢？res文件里是M原子是0.5个，分子里应该是1个，那么这个Z是不是就应该是2个了。 在lst文件 Unit-cell contents from UNIT instruction and atom list resp下面的列表里，指的是一个晶胞中的所有原子个数，对吧。这应该跟化合物的分子式成整数比，是吧。 以前一直模模糊糊的，我自己的都是P-1，每次Z值我都按照checkcif文件来整，但最近师弟师妹问我这个问题，我不知道该如何解释了。希望这次自己能真正弄懂。谢谢！ 希望@xi2004老师@ 羊倌老师@ jackdeng老师这些牛人老师帮帮菜鸟。谢谢！ |
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6楼2014-12-31 20:12:21
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