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shuaiblue

银虫 (小有名气)

[求助] 求教晶体结构中游离水的数目与cif文件分子式的不同,如何解决!谢谢~

求教:用降低空间群的方法解出的晶体,在升高空间群之后,晶体结构中显示的是一个游离水分子,可是生成的cif文件里的分子式却是两个游离水分子,两者不符,就像两个水分子重叠了一样,该如何解决呢?谢谢
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ZJboy

木虫 (著名写手)

两个水可能是对称性等同的,在较高的空间群中......

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2楼2012-09-22 20:44:12
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shuaiblue

银虫 (小有名气)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by ZJboy at 2012-09-22 20:44:12
两个水可能是对称性等同的,在较高的空间群中......

那请问如何解决呢?或者这是可以存在的吗?
3楼2012-09-22 22:30:32
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luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
linhua0402313: 金币+1, 感谢回帖交流,欢迎常来晶体板块 2012-09-23 09:48:55
首先说没有看到具体的结构很难定论。如果两个水的距离在化学上是合理的,可以考虑调整O原子的占有率,专业说法叫几率占据,也就是在一个单胞里水分子在A处,在另一个单胞里,水分子在B处。如果两个水分子的距离不合理,可能是晶胞定错了。建议用尽可能多的画面重修晶胞,确保晶胞参数准确,之后的结构模型才有意义。另外,因为单凭衍射花样不能确定有些空间群是有心还是无心的,建议在相应的无心空间群下精修结构,也许会有意想不到的结果。
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
4楼2012-09-22 22:57:00
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