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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » 启动子区域相关元件预测及蛋白功能预测
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王平阳

金虫 (正式写手)

[求助] 启动子区域相关元件预测及蛋白功能预测 已有2人参与

各位大神，求助求助！！！！
我克隆了一个基因的启动子，启动子的核心元件已经找到，我想在启动子区域找一下还有没有其他元件，比如转录调控因子结合位点，不知道怎么找？另外，我已经克隆了这个基因的全长，怎么来预测这个基因的功能，我将核酸序列、氨基酸序列分别在NCBI上BLAST比对，给出的结果完全不一样，我又在线预测了该基因的三级结构，根据三级结构预测的功能与之前的BLAST的结果又不一样，我该相信哪个？
烦请生物信息学大师及做过相关分析的大神解答，小弟感激不尽！
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没有做不到，只有想不到！
1楼 2014-12-24 15:23:28
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cuihao102

木虫 (小有名气)
不同的调控子结合位点是不一样的，好像还没有专门的预测软件，想确定的话就得通过实验  EMSA  DNaseI footprinting

[ 发自小木虫客户端 ]
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3楼2014-12-24 16:52:19
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红卫大兵

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
网上在线有很多预测软件，你可以在网上百度一下或者在小木虫搜一席都会有很多的信息。
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2楼2014-12-24 16:23:42
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王平阳

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 红卫大兵 at 2014-12-24 16:23:42
网上在线有很多预测软件，你可以在网上百度一下或者在小木虫搜一席都会有很多的信息。

谢谢你的建议
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没有做不到，只有想不到！
4楼2014-12-26 14:33:14
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王平阳

金虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by cuihao102 at 2014-12-24 16:52:19
不同的调控子结合位点是不一样的，好像还没有专门的预测软件，想确定的话就得通过实验  EMSA  DNaseI footprinting

谢谢，通过实验当然有说服力，可是也很盲目，而且费时！
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没有做不到，只有想不到！
5楼2014-12-26 14:34:54
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