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未央于一

金虫 (小有名气)

[求助] Gaussian建模 已有4人参与

我的问题是:在gaussian的Atom List Editor中导出的原子坐标位置信息(txt格式),怎么反过来在gaussian以及MS中建模?有没有简单地方法,不要一个个的输入原子坐标
谢谢
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wbf3ng

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
按pdb,mol,cif的相应格式存成文件,然后用ms打开,不就行了?反过来,用gv 已能打开并生成gaussian 文件

[ 发自小木虫客户端 ]
2楼2014-12-19 07:04:38
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赵红霞

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
只要有坐标了,存为合适的文件类型在gaussian和MS都是可以直接读取的,干嘛要一个一个输啊
3楼2014-12-19 09:11:38
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sunquan0905

木虫 (著名写手)

冥王

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
用Gaussian View或者Chem3D做完图存成gjf格式的可以直接生成坐标,保存成mol或者cif格式的可以直接用MS打开的
一花一世界,一木一浮生,一草一天堂,一叶一如来;一砂一极乐,一方一净土,一笑一尘缘,一念一清净。
4楼2014-12-19 09:33:50
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未央于一

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by sunquan0905 at 2014-12-19 09:33:50
用Gaussian View或者Chem3D做完图存成gjf格式的可以直接生成坐标,保存成mol或者cif格式的可以直接用MS打开的

这个我知道,我想问的是,得到坐标之后,怎么快速的做出结构图
谢谢
5楼2014-12-19 10:39:52
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qchem

铁杆木虫 (著名写手)


【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
打开不就是图了吗?

[ 发自小木虫客户端 ]
6楼2014-12-19 16:59:27
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sunquan0905

木虫 (著名写手)

冥王

【答案】应助回帖

引用回帖:
5楼: Originally posted by 未央于一 at 2014-12-19 10:39:52
这个我知道,我想问的是,得到坐标之后,怎么快速的做出结构图
谢谢...

结构图你可以把output文件转化成gjf格式的,然后代入到Chem3D当中去,Chem3D右侧有一个ChemDraw区域直接就显示出伞形结构的,注意的是,你要根据你自己的喜好去调节位置,这样ChemDraw区域中的结构式会出现变动。
一花一世界,一木一浮生,一草一天堂,一叶一如来;一砂一极乐,一方一净土,一笑一尘缘,一念一清净。
7楼2014-12-20 08:25:07
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nuolan

新虫 (初入文坛)

有一个学计算的呀,唉,当初就是学计算,工作不好找啊!

[ 发自小木虫客户端 ]
8楼2014-12-20 08:34:31
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