24小时热门版块排行榜    

查看: 3051  |  回复: 9

kehan_1230

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】求助一个关于chem 3D的问题 已有6人参与

本人没用过Chem office,现在需要用里面的Chem 3D画一个有机分子的三维图,需要达到的效果如下图所示。现在已经采用Chem draw得到这个有机分子的平面结构,见下图。采用的版本是Chemoffice2002。请各位会用Chem office的大侠们指点。



[ Last edited by kehan_1230 on 2010-7-23 at 02:07 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kehan_1230

铜虫 (小有名气)

1。从Chem Draw中直接把2D的分子式粘贴到Chem 3D中,显示的是球棍模型,怎样将其显示形式修改为下图所示的棒状模型?
2。个人感觉要得到3D构象是不是需要进行能量优化取能量最小的构象?如果是,该如何使用Chem 3D进行能量优化?
2楼2010-07-23 01:53:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kehan_1230

铜虫 (小有名气)

琢磨了手册,已经搞定上述问题,请求删帖,谢谢……
3楼2010-07-23 03:12:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gaoqunqunl

金虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
楼主,是怎么样做出来的?可以分享一下经验吗
4楼2010-07-23 09:48:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nh13

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-24 11:19:00
建议你在用别的软件优化一下,MM2力场优化了的应该是局部最低能量构象吧。
5楼2010-07-23 09:52:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kehan_1230

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by nh13 at 2010-07-23 09:52:30:
建议你在用别的软件优化一下,MM2力场优化了的应该是局部最低能量构象吧。

别的软件,能否建议下。
谢谢。
6楼2010-07-23 11:28:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

nh13

木虫 (正式写手)

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-24 11:19:08
最好能用Gaussian或ADF等量化工具。
7楼2010-07-23 12:46:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kekexiliwolf

金虫 (正式写手)

小屁虫

★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+1):谢谢 2010-07-24 11:19:15
chemioffice2008可以用MMFF94优化,结果还不错哦,
我们在为了文章而搞科研
8楼2010-07-24 00:12:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

雪狼乖乖

木虫 (正式写手)


★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+4):谢谢 2010-07-24 11:19:24
CHEMdraw 转3D 只要保存一下 然后用3D打开即可 至于优化等等 MM2算法只能定性而已 而且有时候会破坏平面 还是用专门的量化软件比较好
给你提个醒: 3D软件里会有孤对电子 而这个数据可能会造成其他软件识别错误 导入时需要删除
chem3D 画画图可以 如果指望它做计算 估计算出来的值 你也不敢用 不过它加载的MOPAC倒是很好的计算大分子的模块 其他还是用专门的量化计算软件吧 3D曾经计算一个分子画了我4天时间 GAUSSIAN03只用了十几分钟 但对于你这样的大分子 应该先力场处理 再用gaussian计算 否则耗时相当多 优化基组不易过大

[ Last edited by 雪狼乖乖 on 2010-7-24 at 06:26 ]
9楼2010-07-24 00:35:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

janetin

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
chem office还是很麻烦的。
10楼2011-03-14 10:25:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 kehan_1230 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 9/450 2026-08-04 07:46 by k7OM8YghWbkC
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 07:37 by k7OM8YghWbkC
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 13/650 2026-08-04 07:30 by k7OM8YghWbkC
[教师之家] 基础研究怎么拉横向,学校到款任务越来越多,难以完成 拉横向,都有哪些途径啊 +9 锦衣卫寒战 2026-07-28 13/650 2026-08-04 07:21 by Ermito
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 6/300 2026-08-04 06:10 by k7OM8YghWbkC
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +4 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 9/450 2026-08-04 06:07 by k7OM8YghWbkC
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 4/200 2026-08-04 04:54 by k7OM8YghWbkC
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 jRl3mE6ddZGq 2026-08-03 6/300 2026-08-04 04:47 by k7OM8YghWbkC
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 7/350 2026-08-04 04:46 by k7OM8YghWbkC
[博后之家] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 8/400 2026-08-04 04:46 by k7OM8YghWbkC
[有机交流] 一个有机合成实验室都需要哪些设备? 50+3 kf2781974 2026-07-31 9/450 2026-08-04 03:56 by kf2781974
[考研] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cu9Nq1xK233Z 2026-08-03 8/400 2026-08-04 03:21 by k7OM8YghWbkC
[高分子] UV压敏胶开发 +3 ichall 2026-07-30 5/250 2026-08-03 14:40 by Sunrisepay
[基金申请] 面上提前没消息,有中的吗 +14 archvillain 2026-08-02 16/800 2026-08-03 12:23 by fuweiguochen
[基金申请] 面上再次挂了,太难了,躺也躺不了,倦也卷不过,小学校之殇! +19 低垂的野花 2026-07-31 25/1250 2026-08-03 09:25 by gy116024
[基金申请] 2026年国自然面上资助率 +16 布布和一二 2026-07-30 22/1100 2026-08-03 09:20 by gy116024
[基金申请] 微信指数没变化,科研之友没阅读 +15 wangze12014 2026-07-28 19/950 2026-08-02 20:05 by 蔡棒棒菂
[高分子] HXDI做水性聚氨酯乳液,是不是特别容易出渣 15+3 yuyusuv 2026-07-29 3/150 2026-07-31 09:21 by huizingga
[基金申请] 系统今天又提示维护了,估计离放榜不远了 +11 winnerche 2026-07-29 15/750 2026-07-30 23:08 by jnhyjjm
[基金申请] 你们的时间戳变了吗 +3 archvillain 2026-07-30 4/200 2026-07-30 18:53 by levinzhwen
信息提示
请填处理意见