24小时热门版块排行榜    

查看: 2931  |  回复: 26

mantou满

铁虫 (初入文坛)

[求助] Fukui函数与Population analysis

本人初次接触Dmol3,在看密立根电荷时应用Fukui function和Population analysis都能得到密立根电荷的数值,但是有差别,请问差别在哪里?请各大虫指点迷津~
回复此楼
生活不易吖。。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-23 16:27:34
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的意义,与活性变化相关,来自于电负性均衡原理,徐光宪的中册的密度泛函章节有简单介绍。关于活性位点和电荷分析可参考Sob博士的帖子,有更多的描述,甚至可以直接咨询,他是这方面专家。

一般直接求f(+)、f(-)的导数通常是通过有限差分近似,但是尤其要小心的是Dmol3中的差分电荷是0.01而不是1,在很多低档次的文章我都见过相关错误,详细参见Dmol3的Fukui function的help部分。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-04-23 14:56:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-23 14:56:49
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的 ...

那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?
生活不易吖。。。。
3楼2014-04-23 19:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-24 15:25:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-23 19:29:09
那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?...

得到原子电荷q有很多种方法,其中一种是Mulliken,是一种分子中将原子间区域的电子对半分的方案(表述的不精确)。因为对于电子尺寸而言,其波动性不可忽略,为了简化描述分子上电荷的分布,就把电荷按照一定方式划分归属到原子,就是原子电荷布居分析。划分电荷的方案很多,fukui又是原子电荷的导数,所以Fukui函数计算时,应该指明采用的布居方法。Dmol3支持的方案有Hirshfeld和Mulliken两种布居分析,对应就有两种Fukui函数。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-04-23 21:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-23 21:54:47
得到原子电荷q有很多种方法,其中一种是Mulliken,是一种分子中将原子间区域的电子对半分的方案(表述的不精确)。因为对于电子尺寸而言,其波动性不可忽略,为了简化描述分子上电荷的分布,就把电荷按照一定方式划 ...

我好像明白了,可是我怎么给你金币吖。。。。
生活不易吖。。。。
5楼2014-04-24 17:17:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
4楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-23 21:54:47
得到原子电荷q有很多种方法,其中一种是Mulliken,是一种分子中将原子间区域的电子对半分的方案(表述的不精确)。因为对于电子尺寸而言,其波动性不可忽略,为了简化描述分子上电荷的分布,就把电荷按照一定方式划 ...

我在用Dmol3时有一步需要将两个分子连接在一起,一个染料和纤维,是直接把结构连在一起就行吗?在复制粘贴结构的时候两个结构的位置能自己设定吗?
生活不易吖。。。。
6楼2014-04-28 18:29:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
6楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-28 18:29:45
我在用Dmol3时有一步需要将两个分子连接在一起,一个染料和纤维,是直接把结构连在一起就行吗?在复制粘贴结构的时候两个结构的位置能自己设定吗?...

这个是个建模的问题,可以,选中一个片段,按住shift进行移动吧。。或者你也可以连接两个片段后clean,在去掉bond,这你就自己摸索吧。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2014-04-28 18:36:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
7楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-28 18:36:31
这个是个建模的问题,可以,选中一个片段,按住shift进行移动吧。。或者你也可以连接两个片段后clean,在去掉bond,这你就自己摸索吧。...

那你知道怎么在这个体系中添加离子性溶剂吗?譬如NaCl
生活不易吖。。。。
8楼2014-04-28 18:38:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
8楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-28 18:38:31
那你知道怎么在这个体系中添加离子性溶剂吗?譬如NaCl...

一般提供了溶剂,我不知道你指的NaCl是水溶液还是熔融的NaCl,如果是水溶液建议就用水作溶剂NaCl做显式(直接加)吧,这没有办法,Dmol3的溶剂化参数似乎无法修改。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
9楼2014-04-28 18:46:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
9楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-28 18:46:46
一般提供了溶剂,我不知道你指的NaCl是水溶液还是熔融的NaCl,如果是水溶液建议就用水作溶剂NaCl做显式(直接加)吧,这没有办法,Dmol3的溶剂化参数似乎无法修改。...

我用的是水溶液,那就是直接在建模的时候加NaCl,然后用水做溶剂?
生活不易吖。。。。
10楼2014-04-28 18:49:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 mantou满 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 327求调剂 +6 拾光任染 2026-03-15 11/550 2026-03-15 22:47 by 拾光任染
[考研] 调剂 +8 调剂的考研学生 2026-03-09 8/400 2026-03-15 22:14 by Winj1e
[文学芳草园] 伙伴们,祝我生日快乐吧 +15 myrtle 2026-03-10 24/1200 2026-03-15 21:16 by 苏州_逗号
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 297一志愿上交085600求调剂 +5 指尖八千里 2026-03-14 5/250 2026-03-14 17:26 by a不易
[考研] 一志愿哈工大材料324分求调剂 +5 闫旭东 2026-03-14 5/250 2026-03-14 14:53 by 木瓜膏
[考研] 材料080500调剂求收留 +3 一颗meteor 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:54 by peike
[考研] 301求调剂 +3 归零lbm 2026-03-09 3/150 2026-03-14 02:20 by JourneyLucky
[考研] 328,0703考生求调剂,一志愿为东北师范大学 +4 观素律 2026-03-09 5/250 2026-03-14 01:24 by JourneyLucky
[考研] 311求调剂 +5 牛乳糖的卡卡 2026-03-10 5/250 2026-03-14 00:05 by JourneyLucky
[考研] 求调剂(材料与化工327) +4 爱吃香菜啦 2026-03-11 4/200 2026-03-13 22:11 by JourneyLucky
[考研] 301求调剂 +6 Liyouyumairs 2026-03-11 6/300 2026-03-13 20:11 by JourneyLucky
[考研] 293求调剂 +3 世界首富 2026-03-11 3/150 2026-03-13 16:27 by JourneyLucky
[考研] 一志愿山大07化学 332分 四六级已过 本科山东双非 求调剂! +3 不想理你 2026-03-12 3/150 2026-03-13 14:18 by JourneyLucky
[考研] 277求调剂 +4 anchor17 2026-03-12 4/200 2026-03-13 11:15 by 白夜悠长
[考研] 0856化工原理 +6 z2839474511 2026-03-10 6/300 2026-03-13 10:41 by houyaoxu
[考研] 290求调剂 +3 ADT 2026-03-13 3/150 2026-03-13 10:19 by peike
[考研] 341求调剂 +4 捣蛋猪猪 2026-03-11 4/200 2026-03-12 14:47 by ruiyingmiao
[考研] 085602化工求调剂 +7 董boxing 2026-03-10 7/350 2026-03-10 17:07 by BruceLiu320
[考研] 294 英二数二物化 求调剂 +6 米饭团不好吃 2026-03-09 6/300 2026-03-09 23:55 by barlinike
信息提示
请填处理意见