24小时热门版块排行榜    

查看: 3358  |  回复: 26
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

[求助] Fukui函数与Population analysis

本人初次接触Dmol3,在看密立根电荷时应用Fukui function和Population analysis都能得到密立根电荷的数值,但是有差别,请问差别在哪里?请各大虫指点迷津~
回复此楼
生活不易吖。。。。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

引用回帖:
6楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-28 18:29:45
我在用Dmol3时有一步需要将两个分子连接在一起,一个染料和纤维,是直接把结构连在一起就行吗?在复制粘贴结构的时候两个结构的位置能自己设定吗?...

这个是个建模的问题,可以,选中一个片段,按住shift进行移动吧。。或者你也可以连接两个片段后clean,在去掉bond,这你就自己摸索吧。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
7楼2014-04-28 18:36:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 27 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-23 16:27:34
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的意义,与活性变化相关,来自于电负性均衡原理,徐光宪的中册的密度泛函章节有简单介绍。关于活性位点和电荷分析可参考Sob博士的帖子,有更多的描述,甚至可以直接咨询,他是这方面专家。

一般直接求f(+)、f(-)的导数通常是通过有限差分近似,但是尤其要小心的是Dmol3中的差分电荷是0.01而不是1,在很多低档次的文章我都见过相关错误,详细参见Dmol3的Fukui function的help部分。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-04-23 14:56:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mantou满

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-04-23 14:56:49
做个不恰当但是直观的比喻,电荷相当于位移,Fukui function就相当于速度。

假设中性分子的某原子Mulliken电荷为q,Mulliken电荷表示的Fukui函数指的是dq/dN,但是左右导数不是相同的dq/dN(+)和dq/dN(-)有各自的 ...

那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?
生活不易吖。。。。
3楼2014-04-23 19:29:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur

★ ★ ★
gmy1990: 金币+3 2014-04-24 15:25:59
引用回帖:
3楼: Originally posted by mantou满 at 2014-04-23 19:29:09
那Population analysis得到的Mulliken电荷呢?...

得到原子电荷q有很多种方法,其中一种是Mulliken,是一种分子中将原子间区域的电子对半分的方案(表述的不精确)。因为对于电子尺寸而言,其波动性不可忽略,为了简化描述分子上电荷的分布,就把电荷按照一定方式划分归属到原子,就是原子电荷布居分析。划分电荷的方案很多,fukui又是原子电荷的导数,所以Fukui函数计算时,应该指明采用的布居方法。Dmol3支持的方案有Hirshfeld和Mulliken两种布居分析,对应就有两种Fukui函数。
不一定挂在论坛,计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-04-23 21:54:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:39 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:27 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 01:15 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 E4V9bALS54sj 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:51 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区文章,我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:15 by 9i7PCSZyMzot
[硕博家园] 售SCI-T0P文章,我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 3/150 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-20 00:03 by 9i7PCSZyMzot
[基金申请] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:39 by 9i7PCSZyMzot
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:27 by 9i7PCSZyMzot
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-19 4/200 2026-09-19 23:03 by 9i7PCSZyMzot
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 4pRyVGCVerAA 2026-09-18 7/350 2026-09-19 21:03 by 9i7PCSZyMzot
[教师之家] 现代”学阀”该如何界定 +3 iaeyuan 2026-09-19 3/150 2026-09-19 20:52 by 没昵称呀
[基金申请] 国社科系统bug了,是不是要放榜了? +7 kynobel 2026-09-16 9/450 2026-09-19 14:52 by 接好运婷
[考博] 申博发邮件 +8 Lmengk 2026-09-15 9/450 2026-09-19 09:27 by 中间体超市
[有机交流] 各位大神,目前国内有哪些比较好用的逆合成软件? 20+3 zapen 2026-09-15 9/450 2026-09-18 18:17 by zapen
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组|2027级博士研究生招生公告 +7 水士口 2026-09-16 8/400 2026-09-16 13:47 by kkklens
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +8 两三岁ss 2026-09-14 8/400 2026-09-16 09:46 by 水士口
信息提示
请填处理意见