应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » 其他 » 关于MS DMOL3模块算过渡态的问题，急！！！！
51/1返回列表
查看: 2248  |  回复: 7
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

zhuhy1116

新虫 (初入文坛)

[求助] 关于MS DMOL3模块算过渡态的问题，急！！！！

本人最近正在研究金属催化剂对煤焦还原NO的影响，但是采用的是dmol模块，我构建了金属切面，选择了焦炭模型和NO分子同时吸附在切面上，但是算出来的过渡态虚频很多，而且振动强度都为零，我想问一下是我的方法有问题么？用castep来算的话，怎么保证你算得过渡态的正确性，因为不像dmol模块可以通过频率分析来确认过渡态是否准确啊。
Frequency (1/cm)          Intensity (km/mol)
-699.22000000        0.00000000
-497.61000000        0.00000000
-44.83000000        0.00000000
-40.25000000        0.00000000
-38.84000000        0.00000000
-34.48000000        0.00000000
-32.98000000        0.00000000
-27.25000000        0.00000000
-24.72000000        0.00000000
-22.35000000        0.00000000
-21.64000000        0.00000000
-18.19000000        0.00000000
-14.31000000        0.00000000
-7.72000000        0.00000000
-1.51000000        0.00000000
11.69000000        0.00000000
16.69000000        0.00000000
18.17000000        0.00000000
22.62000000        0.00000000
27.23000000        0.00000000
28.68000000        0.00000000
29.27000000        0.00000000
32.47000000        0.00000000
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼2014-12-15 15:35:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
5楼: Originally posted by zhuhy1116 at 2014-12-22 15:34:56
频率不是算出来了呢，但是振动强度都是零，不收敛是在过渡态优化的过程中，而且这个算出来的虚频也太多了···...

不是算的频率是看不到振动模的（振动强度），而且Hessian矩阵不够精确，没啥参考意义。补充频率计算吧。

如果过渡态不收敛，只能通过修改那些DIIS和charge mix等来增加收敛的可能。金属切面的话要保证k和smearing都非常充分、合适。一些带磁性的金属可能处理起来会比较棘手，如果是这样就没办法了。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
6楼2014-12-22 16:20:00
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
★ ★
gmy1990: 金币+2, 感谢应助 2014-12-19 18:54:38
DMol3你想看到频率的详细信息必须得进行性质中频率计算，这里给出的频率我估计应该是几何优化过程采用的粗糙的Hessian估计的。MS下CASTEP做反应确实稍弱一些。
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
2楼2014-12-17 14:16:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuhy1116

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 卡开发发 at 2014-12-17 14:16:13
DMol3你想看到频率的详细信息必须得进行性质中频率计算，这里给出的频率我估计应该是几何优化过程采用的粗糙的Hessian估计的。MS下CASTEP做反应确实稍弱一些。

我现在是一直卡在这里进行不下去，进行过渡态优化也是收敛不了，怎么办呐···
赞一下 回复此楼
3楼2014-12-17 15:01:53
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

卡开发发

专家顾问 (著名写手)

Ab Initio Amateur
引用回帖:
3楼: Originally posted by zhuhy1116 at 2014-12-17 15:01:53
我现在是一直卡在这里进行不下去，进行过渡态优化也是收敛不了，怎么办呐···...

我不知道你指的不收敛是？到底是频率算不出，还是过渡态搜索不出？或是过渡态优化结构的过程不能收敛？
赞一下 回复此楼
不一定挂在论坛，计算问题问题欢迎留言。
4楼2014-12-19 09:50:03
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭