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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 【求助】dmol 计算过渡态问题
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lishufei

金虫 (正式写手)

[交流] 【求助】dmol 计算过渡态问题

请教各位前辈
       我做mg参杂3d金属解离氢分子。需要算过渡态即计算其需要克服能垒。我所有的精度为fine，结果光参ni元素计算了一周都没反应（4cpu），大家用dmol计算过渡态是什么系统什么精度大约多长时间能计算完（我的性质里计算频率啦），想对比一下是不是我的设计反应本身就错啦。那样我就没必要计算啦。谢谢大家
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1楼 2010-11-14 17:12:54
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涅磐BornFirn

银虫 (正式写手)
★ ★
lishufei(金币+3): 2010-11-14 18:59:09
zzy870720z(金币+2):谢谢指教 2010-12-20 10:15:49
如果你用的是MS5.0我建议你还是去掉频率计算，只找过渡态！！然后再单独算频率！你的体系不知道多大！我的8核，一般找过渡态不计算频率是15小时左右！（体系70~80原子）单独算频率是48小时

[ Last edited by 涅磐BornFirn on 2010-11-14 at 17:40 ]
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2楼2010-11-14 17:37:49
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lishufei

金虫 (正式写手)
[quote]Originally posted by 涅磐BornFirn at 2010-11-14 17:37:49:
如果你用的是MS5.0我建议你还是去掉频率计算，只找过渡态！！然后再单独算频率！你的体系不知道多大！我的8核，一般找过渡态不计算频率是15小时左右！（体系70~80原子）单独算频率是48小时

[ Last edited by  ... [/quot谢谢回复
我用的是ms4.0计算的40多个原子，有一个3d金属。精度设置是fine。都是了一周啦（4核），path都出来7个啦，就是没有过渡态位置。郁闷啊，是不是设计有问题啊？
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3楼2010-11-14 19:07:54
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涅磐BornFirn

银虫 (正式写手)
★
mazuju028(金币+1):谢谢交流 2010-11-14 22:29:42
要不你把设置收敛精度 改为medium ,即 RMS 收敛精度 为0.01 其它保持Fine
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4楼2010-11-14 22:23:36
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lishufei

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 涅磐BornFirn at 2010-11-14 22:23:36:
要不你把设置收敛精度 改为medium ,即 RMS 收敛精度 为0.01 其它保持Fine

这样改变设置时有助于加快计算，还是什么啊？ RMS是限制什么的啊？
我最主要的是怕它产生多个虚频，这个设置影响影响不影响虚频数目啊？
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5楼2010-11-15 08:33:09
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匿名

用户注销 (职业作家)
★
ym23(金币+1):谢谢参与 2010-11-15 09:55:23
lishufei(金币+2): 2010-11-15 14:42:57
本帖仅楼主可见
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6楼2010-11-15 08:47:08
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xiaoqian830606

金虫 (小有名气)
我在计算的时候也会发生诸如此类的问题，过渡态计算不下去了发生错误了，是不是错误一般都是发生参数设置上？
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7楼2010-12-20 09:59:32
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lishufei

金虫 (正式写手)
★
zzy870720z(金币+1):谢谢交流 2010-12-20 10:30:42
引用回帖:
Originally posted by xiaoqian830606 at 2010-12-20 09:59:32:
我在计算的时候也会发生诸如此类的问题，过渡态计算不下去了发生错误了，是不是错误一般都是发生参数设置上？

过渡态计算错误有很多原因，可能你的初始结构就有问题。也可能你的反应路径。你看看输出文件再说。
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8楼2010-12-20 10:28:32
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寒心雪

铁虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
2065478楼: Originally posted by 涅磐BornFirn at 2010-11-14 17:37:49:
如果你用的是MS5.0我建议你还是去掉频率计算，只找过渡态！！然后再单独算频率！你的体系不知道多大！我的8核，一般找过渡态不计算频率是15小时左右！（体系70~80原子）单独算频率是48小时

请问一下你的电脑配置是怎么样的？CUP什么牌子的，主频多少，内存多大？内存读取速率有关系么？
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9楼2012-04-18 17:47:20
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USTC_STM

金虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
先可以用粗精度算，然后再fine，4core似乎跑起来很费劲。
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10楼2013-03-14 16:03:15
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