24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 5511  |  回复: 4

永峰1230

铜虫 (小有名气)

[求助] NCBI提交序列 中含有终止密码子怎么办 已有1人参与

向ncbi中提交序列, 其中有几个含有 终止密码子, 应该怎么注释呢?  序列是个蛋白的序列
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

12
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
永峰1230: 金币+5, ★★★很有帮助 2014-12-11 11:30:30
你说的“序列是个蛋白的序列”,是想说你提交的序列是编码蛋白的核酸序列吧?另外你并没有说清楚你提交的是个什么序列?是编码区?还是全长cDNA?还是基因组序列?你说的终止密码子是正常组成?还是测序的突变?或者也有可能是你选错了遗传密码表(如线粒体基因组的遗传密码表并不是通用密码表)。
2楼2014-12-11 00:25:46
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永峰1230

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by stone2239 at 2014-12-11 00:25:46
你说的“序列是个蛋白的序列”,是想说你提交的序列是编码蛋白的核酸序列吧?另外你并没有说清楚你提交的是个什么序列?是编码区?还是全长cDNA?还是基因组序列?你说的终止密码子是正常组成?还是测序的突变?或者 ...

是基因组序列, 在提交的时候会要翻译成蛋白质,  但是中间有终止密码子,, 不是线粒体基因组,
12
3楼2014-12-11 11:30:21
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

stone2239

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2014-12-16 11:36:11
引用回帖:
3楼: Originally posted by 永峰1230 at 2014-12-11 11:30:21
是基因组序列, 在提交的时候会要翻译成蛋白质,  但是中间有终止密码子,, 不是线粒体基因组,...

基因组序列,如果是真核生物你要考虑该基因是否有内含子,翻译时,要把内含子去掉。如果无内含子,我觉得有两种情况:①你的基因组该位点发生无义突变;②你的基因组该处是正常的,你PCR合成该基因时出错,测序结果有误。可以多测几个克隆载体,通过比较各测序结果在该位点的碱基是否一致来判断属于哪种情况。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2014-12-11 12:10:38
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

永峰1230

铜虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by stone2239 at 2014-12-11 12:10:38
基因组序列,如果是真核生物你要考虑该基因是否有内含子,翻译时,要把内含子去掉。如果无内含子,我觉得有两种情况:①你的基因组该位点发生无义突变;②你的基因组该处是正常的,你PCR合成该基因时出错,测序结果 ...

原核生物,,
12
5楼2014-12-16 09:36:55
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 永峰1230 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 河北省自然科学基金 +5 Peterchao 2026-05-18 8/400 2026-05-24 11:58 by 晓晓爱翠翠
[考博] 云南大学材料与能源学院解琳课题组钙钛矿博士招生 +4 光伏爱好者 2026-05-17 7/350 2026-05-24 10:20 by 光伏爱好者
[基金申请] 西安交大新媒学院副院长用撤稿论文结题 +3 bjvtcliu 2026-05-24 5/250 2026-05-24 10:16 by kudofaye
[教师之家] 论文撤稿了 +3 bjvtcliu 2026-05-24 5/250 2026-05-24 10:06 by Equinoxhua
[教师之家] 某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路! +4 zju2000 2026-05-21 5/250 2026-05-24 09:35 by songwz
[考博] 26/27申博自荐 10+4 ZXW0202 2026-05-22 9/450 2026-05-24 08:47 by bjvtcliu
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hvkbtfonbv 2026-05-23 3/150 2026-05-24 08:01 by 9ps9vgkqva
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 pmo95bazuy 2026-05-23 7/350 2026-05-24 06:35 by fpo5ljpv91
[基金申请] 揭秘青基评审内幕:几个A才能顺利中标 +3 国自然国社科中 2026-05-23 4/200 2026-05-23 15:37 by 2000zf36392
[论文投稿] 投稿求助,期刊 +4 希冀,有书读 2026-05-20 8/400 2026-05-22 10:16 by 希冀,有书读
[文学芳草园] 献血感触 +7 呀呀好傻 2026-05-19 13/650 2026-05-21 20:15 by 呀呀好傻
[基金申请] 面上本子正文33页,违规吗?会被低分嘛? +14 1234567wang 2026-05-17 16/800 2026-05-21 17:58 by 脆脆的饼干
[基金申请] 国自然评分 +4 无名者登山 2026-05-20 5/250 2026-05-21 16:35 by swuq
[基金申请] 国自然上会要求 +7 无名者登山 2026-05-18 11/550 2026-05-21 15:50 by draco1987
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +9 fummck 2026-05-20 10/500 2026-05-21 14:17 by draco1987
[基金申请] 评审有感 +15 popular289 2026-05-18 26/1300 2026-05-21 10:35 by 西葫芦炒鸡蛋
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 8/400 2026-05-20 22:19 by Equinoxhua
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
信息提示
请填处理意见