24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 956  |  回复: 2

lanlanwa9002

铁虫 (小有名气)

[求助] (求大神)SIESTA %block Zmatrix 疑问

我用SIESTA 计算表面的吸附性质,由于需要固定键长,所以原子坐标区块选择了内坐标形式 :%block Zmatrix。在计算中却发现计算常常在并未到达受力收敛标准0.01 eV/Ang,的情况下就正常结束了。即便还在算,也总是达不到这个标准。想这是怎么回事呢?于是我放开对键长的限制,可还是达不到受力标准,可见并不像是约束导致的。然后我换了一个苯分子在某金属表面吸附的简单模型,发现依旧是受力不收敛。于是我想请教各位大牛:请问是不是使用了%block Zmatrix之后,在自洽场计算部分或结构优化部分还需要做什么特殊的设置啊?
附(.fdf文件):
SystemName          M
SystemLabel         1

NumberOfAtoms       84
NumberOfSpecies     8

%block ChemicalSpeciesLabel
1    13    Al
2    14    Si
3    8     O
5    12    Mg
4    1     H
6    11    Na
7    8     O_surf
8    1     H_surf
%endblock ChemicalSpeciesLabel

PAO.BasisSize       DZP
PAO.EnergyShift     320 meV
PAO.SplitNorm       0.23

LatticeConstant     1 Ang
%block LatticeVectors
10.360  0.000   0.000
  0.000  8.98    0.000
  0.000  0.000   40.00
%endblock LatticeVectors

%block kgrid_Monkhorst_Pack
  1   0   0    0.0
  0   1   0    0.0
  0   0   1    0.0
%endblock kgrid_Monkhorst_Pack

XC.functional        GGA           # Exchange-correlation functional
XC.authors           PBE            # Exchange-correlation version
SpinPolarized        F
MeshCutoff           220.0 Ry

MaxSCFIterations    300

DM.NumberPulay       3
DM.Tolerance         1.d-4

SolutionMethod       diagon
DM.MixingWeight       0.25          # New DM amount for next SCF cycle
#ElectronicTemperature  25 meV

# MD options

MD.TypeOfRun         CG
MD.NumCGsteps        1000
ZM.UnitsLength          Ang           #the units of length used during Z-matrix input
ZM.UnitsAngle          deg           #the units of angles used during Z-matrix input
ZM.MaxDisplLength         0.1  Ang          # controls the maximum change in a Zmatrix length during an optimisation step
ZM.ForceTolLength        0.01 eV/Ang            #controls the convergence with respect to forces on Z-matrix lengths
ZM.ForceTolAngle        0.00356549 Ry/rad
ZM.MaxDisplAngle       0.003 rad
MD.VariableCell        F

AtomicCoordinatesFormat  ScaledCartesian
%block Zmatrix
molecule
6   0  0  0   3.642743450   4.585977690   7.416304920      0  0  0
7   1  0  0   2.397         38.321       -122.002          0  1  1
8   1  2  0   3.135         13.167        58.378           1  1  1
8   1  2  3   2.651         21.66         115.885          1  1  1

cartesian
1    4.574144840   3.055682480    3.301943830    0    0    0
1    9.748525910   3.071737580    3.296439130    0    0    0
5    4.575629600   5.991863520    3.323686150    0    0    0
....................
4    0.295759990   0.046124920    4.404757640    0    0    0
4    5.508497320   0.051660940    4.391599880    0    0    0
%endblock Zmatrix
# Output options
WriteCoorXmol       T
WriteCoorCerius     True
WriteCoorStep       True
#-------------------------------------------------------------------------------
#Restart
DM.UseSaveDM   F
MD.UseSaveXV   F
MD.UseSaveCG   F
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lanlanwa9002

铁虫 (小有名气)

下面是很让我无语的每一步的最大原子受力:
   Max    0.488463    constrained
   Max    0.288270    constrained
   Max    0.289708    constrained
   Max    0.279172    constrained
   Max    0.266928    constrained
   Max    0.252177    constrained
   Max    0.237016    constrained
   Max    0.221676    constrained
   Max    0.207109    constrained
   Max    0.191344    constrained
   Max    0.182107    constrained
   Max    0.182359    constrained
   Max    0.182625    constrained
   Max    0.182803    constrained
   Max    0.183053    constrained
   Max    0.183335    constrained
   Max    0.183581    constrained
   Max    0.183842    constrained
   Max    0.187210    constrained
   Max    0.197474    constrained
   Max    0.206927    constrained
   Max    0.216649    constrained
   Max    0.225810    constrained
   Max    0.235189    constrained
   Max    0.244180    constrained
   Max    0.252429    constrained
   Max    0.260475    constrained
   Max    0.268722    constrained
   Max    0.276296    constrained
   Max    0.283475    constrained
   Max    0.290631    constrained
   Max    0.298206    constrained
   Max    0.306024    constrained
   Max    0.313518    constrained
   Max    0.321264    constrained
   Max    0.329415    constrained
   Max    0.325507    constrained
   Max    0.227337    constrained
   Max    0.191721    constrained
   Max    0.229066    constrained
   Max    0.192127    constrained
   Max    0.337578    constrained
   Max    0.191278    constrained
   Max    0.216007    constrained
   Max    0.191841    constrained
   Max    0.191755    constrained
   Max    0.194218    constrained
   Max    0.197301    constrained
   Max    0.202302    constrained
   Max    0.199045    constrained
   Max    0.223329    constrained
   Max    0.190863    constrained
   Max    0.209688    constrained
   Max    0.256961    constrained
   Max    0.215010    constrained
   Max    0.216190    constrained
   Max    0.217720    constrained
   Max    0.220328    constrained
   Max    0.224456    constrained
   Max    0.222023    constrained
   Max    0.190453    constrained
   Max    0.240154    constrained
   Max    0.189719    constrained
   Max    0.295657    constrained
   Max    0.209734    constrained
   Max    0.255772    constrained
   Max    0.232474    constrained
   Max    0.221453    constrained
   Max    0.204881    constrained
   Max    0.190059    constrained
   Max    0.189692    constrained
   Max    0.234808    constrained
   Max    0.210606    constrained
   Max    0.252750    constrained
   Max    0.214895    constrained
   Max    0.212159    constrained
   Max    0.208620    constrained
   Max    0.212499    constrained
   Max    0.198380    constrained
   Max    0.194537    constrained
   Max    0.200486    constrained
   Max    0.228371    constrained
   Max    0.212400    constrained
   Max    0.222177    constrained
   Max    0.221101    constrained
2楼2014-11-30 18:15:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lanlanwa9002

铁虫 (小有名气)

看来是要沉贴了。。。。
3楼2014-12-11 11:41:10
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lanlanwa9002 的主题更新
信息提示
请填处理意见